离职申请书上的“纠纷终结”条款是否具有法律效应，需分情况讨论：

1. 若该条款是双方自愿、平等协商后达成的合意：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事主体从事民事活动，应当遵循自愿原则，按照自己的意思设立、变更、终止民事法律关系。因此，如果离职申请书上的“纠纷终结”条款是双方真实意思的表示，且没有违反法律、行政法规的强制性规定，也没有违背公序良俗，那么该条款是具有法律效应的。这意味着，一旦双方签署了离职申请书，并确认了“纠纷终结”的条款，那么双方就应当受该条款的约束，不得再就离职相关的事宜提起诉讼或仲裁。

2. 若该条款存在欺诈、胁迫、乘人之危等情形：

   • 如果离职申请书上的“纠纷终结”条款是在一方欺诈、胁迫或乘人之危的情况下签署的，那么该条款可能被视为无效。因为根据法律规定，因欺诈、胁迫或乘人之危而订立的合同，受损害方有权请求人民法院或仲裁机构予以撤销。在这种情况下，即使双方已经签署了离职申请书，并确认了“纠纷终结”的条款，受损害方仍然可以就离职相关的事宜提起诉讼或仲裁。

3. 若该条款内容不明确或存在歧义：

   • 如果离职申请书上的“纠纷终结”条款内容不明确或存在歧义，导致双方对该条款的理解存在争议，那么该条款的法律效应可能会受到影响。在这种情况下，双方可能需要通过协商、调解或诉讼等方式来解决争议，并明确该条款的具体含义和适用范围。

法律建议：

• 在签署离职申请书时，务必仔细阅读并理解其中的条款内容，特别是关于“纠纷终结”的条款。如果有任何疑问或不确定的地方，应当及时向用人单位或专业律师咨询。
• 如果认为离职申请书上的“纠纷终结”条款存在不公平、不合理或违法的情况，应当拒绝签署或要求修改。在签署前，也可以考虑与用人单位进行协商，以达成更加公平、合理的离职协议。
• 如果已经签署了离职申请书，并确认了“纠纷终结”的条款，但后来发现该条款存在欺诈、胁迫、乘人之危等情形或内容不明确、存在歧义，应当及时向专业律师咨询，并考虑采取法律措施来维护自己的合法权益。

可能法律后果：

• 如果离职申请书上的“纠纷终结”条款具有法律效应，且双方已经签署并确认了该条款，那么双方就应当受该条款的约束。如果一方违反该条款，可能会面临法律责任和赔偿风险。
• 如果离职申请书上的“纠纷终结”条款被视为无效或存在争议，那么双方可能需要通过法律途径来解决争议。这可能会导致诉讼或仲裁等法律程序的产生，并增加双方的时间和成本投入。

总之，离职申请书上的“纠纷终结”条款是否具有法律效应，取决于该条款的签署过程、内容以及双方的实际情况。在签署前，务必仔细阅读并理解其中的条款内容，并在有疑问或不确定的情况下及时咨询专业律师。如有任何法律问题，也可以直接向我咨询。