公司考核协议是否合法，不能一概而论，需要结合具体情况来判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
协议内容合法性：
- 公司考核协议的内容必须符合国家法律法规的规定，不能违反劳动法、劳动合同法等相关法律条款。例如，协议中不能设定不合理的考核标准，不能将违法违规的行为作为考核内容，也不能剥夺劳动者的合法权益。
- 如果协议内容存在违法之处，如强制加班、不支付加班费、设定不合理的罚款等，那么该协议就是违法的，不具有法律效力。
协议签订程序合法性：
- 考核协议的签订必须遵循平等、自愿、协商一致的原则。公司不能单方面制定考核协议并强制员工签订，员工有权对协议内容进行协商和修改。
- 如果公司在签订协议过程中存在欺诈、胁迫等行为，或者未充分告知员工协议内容，导致员工在不知情的情况下签订协议，那么该协议的签订程序就是违法的，员工有权要求撤销或变更协议。
协议执行合法性：
- 即使考核协议的内容和签订程序都合法，但在执行过程中也必须遵守法律法规的规定。公司不能随意变更考核标准或结果，不能滥用考核权力对员工进行不公正的处罚。
- 如果公司在执行考核协议过程中存在违法行为，如随意扣减工资、解除劳动合同等，员工有权依法维护自己的合法权益。
针对公司考核协议合法性的建议：
- 员工角度：在签订考核协议前，员工应仔细阅读协议内容，了解自己的权利和义务。如果对协议内容有疑问或不满，应及时与公司进行沟通协商。在签订协议后，员工应保留好协议原件或复印件，以备不时之需。如果公司存在违法行为，员工应及时向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
- 公司角度：公司在制定考核协议时，应确保协议内容合法合规，遵循平等、自愿、协商一致的原则。在执行协议过程中，公司应严格按照协议约定进行考核和奖惩，不得滥用权力或违反法律法规的规定。同时，公司也应建立健全的考核机制，确保考核结果的公正性和合理性。
可能存在的法律后果：
- 如果公司考核协议被认定为违法，那么该协议将不具有法律效力。公司可能面临劳动监察部门的处罚，如罚款、责令改正等。同时，员工也有权要求公司承担相应的法律责任，如支付违法解除劳动合同的赔偿金、补发工资等。
总之，公司考核协议的合法性需要从多个角度进行综合判断。如果你对公司考核协议的合法性存在疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。