核心结论：公司用加班调休来抵工作日假是否合法及如何计算，需分情况讨论，具体如下：

1. 调休的合法性基础
   根据《劳动法》第四十四条，用人单位安排劳动者在休息日工作且不能安排补休的，需支付不低于工资200%的加班费；若安排补休（即调休），则无需支付加班费。但调休仅适用于休息日加班（如周六日），若用人单位将工作日（周一至周五）的假期直接替换为调休，可能涉嫌违法，因为工作日属于法定工作时间，用人单位无权单方面变更。

2. 调休的计算规则

   • 休息日加班调休：若劳动者在休息日加班，用人单位可安排同等时长的调休（如加班1天调休1天），调休时间由双方协商确定，但需在合理期限内（通常建议6个月内）安排完毕。
     
   • 工作日假期调休的争议：若用人单位将工作日假期（如年假、事假）与调休混同，需明确：
     
     • 年假：根据《职工带薪年休假条例》，年假是劳动者法定权利，用人单位不得以调休替代年假，除非劳动者书面同意。
       
     • 事假：事假为无薪假期，用人单位无义务安排调休，但若双方协商一致，可约定用后续加班调休抵扣事假。

3. 实务建议

   • 劳动者：若用人单位强制将工作日假期替换为调休，可要求用人单位出具书面说明，并核对是否符合《劳动法》及公司规章制度。若存在争议，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
     
   • 用人单位：调休政策需明确写入劳动合同或规章制度，并经民主程序公示。安排调休时需与劳动者协商一致，避免单方面强制执行。

总结：调休的合法性取决于加班类型（休息日或工作日）及劳动者权益保障。若涉及工作日假期调休，需谨慎审查用人单位政策是否合规。如有具体案例或细节需要进一步分析，可直接向我咨询。