针对您提出的“船长证书被扣分，过几个月才知道扣分且未收到通知签字，是否违法”的问题，我们可以从以下几个方面进行详细解答：

首先，根据《中华人民共和国船员违法记分办法》的相关规定，对于船员的违法记分行为，海事管理机构有明确的记分和通知流程。对于需要实施违法记分的船员违法行为，海事执法人员应向当事船员说明记分分值及记分理由，并认真听取当事船员的陈述、申辩。在决定对船员实施违法记分后，海事执法人员应制作《船员违法记分通知书》，并交由当事船员签名确认。如果当事船员拒绝签名，海事执法人员应在通知书上注明情况。

接下来，我们分析您的情况：

1. 扣分通知的及时性：虽然相关法规并未明确规定海事管理机构必须在扣分后立即通知船员，但按照常规操作和公平原则，船员应在合理时间内得知其扣分情况，以便及时了解自己的违法记分状况并采取相应措施。

2. 未通知签字的问题：如果您在几个月后才得知扣分情况，且未收到任何形式的通知或签字要求，这可能表明海事管理机构在通知流程上存在疏忽或不当。然而，这并不直接构成“违法”，因为法规并未明确规定具体的通知时间或方式。但这种情况确实可能违反了行政管理的公平、公正和透明原则。

3. 您的权益与救济途径：如果您对扣分有异议，或者认为海事管理机构在记分过程中存在不当行为，您可以依照行政复议和行政诉讼的有关规定申请救济。您可以向相关海事管理机构提出申诉，要求其重新审查记分情况，并提供相关证据支持您的观点。

针对您的情况，我们建议您采取以下措施：

• 与海事管理机构沟通：首先，您可以尝试与负责您船长证书记分的海事管理机构进行沟通，了解扣分的具体原因和依据，并询问为何未及时通知您。
• 提出申诉：如果您认为记分存在错误或不当，您可以向该海事管理机构提出申诉，要求其重新审查并更正记分情况。
• 寻求法律援助：如果您在申诉过程中遇到困难或需要法律支持，您可以考虑寻求专业律师的帮助，以维护您的合法权益。

综上所述，虽然海事管理机构在未及时通知您扣分情况方面可能存在疏忽，但这并不直接构成违法。然而，您仍然有权对扣分提出异议并寻求救济。希望以上解答能对您有所帮助。