结论前置：在您描述的情况下，即劳动仲裁确定劳动关系用了一年后才结案，您仍然有权去申请工伤认定，但需注意申请时效及可能面临的挑战。
详细分析：
工伤认定的基本条件：
- 工伤认定首先要求存在劳动关系。在您的情况下，虽然劳动仲裁确定劳动关系用了一年时间，但一旦仲裁结果确认了劳动关系，您就满足了工伤认定的这一基本条件。
工伤认定的申请时效：
- 根据《工伤保险条例》第十七条的规定，职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。遇有特殊情况，经报社会保险行政部门同意，申请时限可以适当延长。
- 如果用人单位未按时提出工伤认定申请，工伤职工或者其近亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
- 关键点：虽然您的劳动关系确认耗时较长，但只要从您知道或应当知道工伤事故发生之日起算，未超过1年的申请时效，您仍然有权申请工伤认定。不过，由于劳动仲裁耗时一年，您需要特别注意是否已超过这一时效限制。若未超过，则可正常申请；若已超过，则可能面临无法申请的困境，但具体还需结合实际情况和当地社保行政部门的解释。
申请工伤认定的流程与材料：
- 申请工伤认定通常需要提交工伤认定申请表、与用人单位存在劳动关系（包括事实劳动关系）的证明材料、医疗诊断证明或者职业病诊断证明书（或者职业病诊断鉴定书）等。
- 在您的情况下，劳动仲裁裁决书将作为证明劳动关系的重要材料。
可能面临的挑战与建议：
- 时效挑战：如前所述，您需要确认从工伤事故发生之日起是否已超过1年的申请时效。若已超过，您可能需要考虑通过其他途径（如与用人单位协商、提起民事诉讼等）来寻求救济。
- 证据收集：在申请工伤认定前，确保您已收集到充分的证据来支持您的申请，包括医疗记录、事故现场照片、证人证言等。
- 专业协助：由于工伤认定涉及复杂的法律程序和专业知识，建议您在申请过程中寻求专业律师的协助，以确保您的权益得到充分保障。
总结与建议：
- 您仍然有权在劳动仲裁确认劳动关系后申请工伤认定，但需注意申请时效是否已超过。
- 准备好充分的证据材料，并按照规定的流程向社会保险行政部门提出申请。
- 如果面临时效挑战或证据收集困难，建议及时咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和帮助。
如有任何进一步的问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问，我会尽力为您提供帮助。