外包合同的工资发放主体通常依据外包协议的具体约定来确定，主要存在以下两种情况：
由外包公司（劳务公司）发放：
- 在常见的劳务外包模式中，您与外包公司签订劳动合同，建立劳动关系。因此，外包公司负责按照劳动合同约定计算并发放工资给您。外包公司从用工单位获取项目费用后，需依法履行代扣代缴个人所得税等义务，并确保工资发放符合法律法规的相关规定，如不得低于当地最低工资标准。
- 举例说明：假设您与一家外包公司签订了劳动合同，并被派遣到某用工单位工作。那么，您的工资应由这家外包公司负责发放，用工单位只需按照外包协议的约定向外包公司支付服务费用。
由用工单位直接发放（特殊约定情况）：
- 根据外包合同的特殊约定，用工单位也可能直接对您发放工资。此时，合同中应明确详细的工资发放标准、时间等具体事项，以确保准确性和及时性。但需注意，这种直接发放方式并非主流，且用工单位在直接发放工资时应谨慎操作，避免被认定为劳务派遣关系，从而影响劳动关系的认定。
- 举例说明：在某些特殊情况下，如用工单位与外包公司有特别约定，或者您的工作性质、岗位等具有特殊性，用工单位可能会直接与您约定工资发放事宜。但这种情况相对较少，且需要明确的合同约定作为依据。
在工资发放过程中，您还需要注意以下几点：
- 资金来源与发放流程：通常情况下，用工单位将款项支付给外包公司，作为服务费用的一部分。外包公司则根据您的出勤情况、工作表现等因素进行工资核算，并负责将工资发放给您。
- 代扣代缴义务：外包公司需依法履行代扣代缴个人所得税的义务，确保您的工资收入合法合规。
- 纠纷解决途径：如果发生工资发放方面的纠纷，您可以通过协商、投诉或劳动仲裁等途径来维护自己的合法权益。首先尝试与相关单位（外包公司或用工单位）进行协商解决；若协商无果，可以向当地的劳动监察部门进行投诉；若投诉仍无法解决问题，您可以向劳动仲裁机构申请仲裁。
最后，我建议您：
- 在签订外包合同时，务必仔细阅读合同条款，特别是关于工资发放、劳动关系认定等方面的约定，确保自己的权益得到充分保障。
- 在工作过程中，保留好与工资发放相关的证据材料，如工资条、银行转账记录等，以便在发生纠纷时能够提供有力的证据支持。
如果您在工资发放方面遇到任何问题或困惑，欢迎直接向我咨询，我将竭诚为您提供专业的法律帮助。