申请综合工时制后，通常不能同时执行标准工时制。以下是对这个问题的详细解答：
一、综合工时制与标准工时制的区别
标准工时制：按照《劳动法》的规定，标准工时制是每日工作不超过8小时，每周工作不超过40小时的工作时间制度。
综合工时制：综合工时制是一种针对特定行业、岗位及生产经营特点而设计的工作时间制度。它不以每日工作时间为计算标准，而是以周、月、季、年为周期综合计算工作时间，但平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准相同，即平均每日不超过8小时，平均每周不超过40小时。
二、申请综合工时制后的执行要求
一旦企业申请了综合工时制并获得了批准，就需要按照综合工时制的要求来安排员工的工作时间。这意味着，在综合计算周期内，员工的工作时间可以灵活安排，但总体上需要保证平均日工作时间和平均周工作时间不超过法定标准。
三、不能同时执行标准工时制的原因
制度冲突：综合工时制和标准工时制是两种不同的工作时间制度，它们的计算方式和要求不同。如果同时执行，会导致管理上的混乱和制度上的冲突。
审批要求：企业申请综合工时制需要经过劳动行政部门的批准，一旦获得批准，就需要按照批准的制度来执行。如果同时执行标准工时制，就违反了审批要求。
员工权益保障：综合工时制的设计是为了适应特定行业、岗位及生产经营特点的需要，同时保障员工的合法权益。如果同时执行标准工时制，可能会损害员工的合法权益，如加班费、休息休假等。
四、结论
因此，申请综合工时制后，企业通常不能同时执行标准工时制。企业需要严格按照批准的综合工时制来安排员工的工作时间，并确保员工的合法权益得到保障。如果企业有特殊情况需要调整工作时间制度，需要重新向劳动行政部门申请并获得批准。