结论：劳动仲裁中，劳动关系确认、工伤认定及停工留薪期确定通常是分步骤进行的，但某些情况下可以并行处理或通过特定程序合并处理。以下从不同角度详细说明：

1. 劳动关系确认与工伤认定的关系

• 劳动关系确认是工伤认定的前提：根据《工伤保险条例》第十八条，申请工伤认定需提交“与用人单位存在劳动关系（包括事实劳动关系）的证明材料”。若劳动关系存在争议（如未签合同、劳务派遣争议等），需先通过劳动仲裁或诉讼确认劳动关系。
• 并行处理的可能性：若劳动者已提供初步证据（如工资记录、工作证等）证明劳动关系，社保部门可能直接受理工伤认定申请，同时要求用人单位在规定期限内举证反驳。若用人单位否认劳动关系，社保部门会中止认定，待劳动仲裁或诉讼确认劳动关系后再恢复。

2. 工伤认定与停工留薪期的确定

• 停工留薪期需以工伤认定为前提：根据《工伤保险条例》第三十三条，停工留薪期是指职工因工作遭受事故伤害或患职业病需要暂停工作接受治疗的期间，其期限由劳动能力鉴定委员会确认，但确认前提是职工已被认定为工伤。
• 特殊情况下的合并处理：若劳动关系明确且工伤事实清楚（如突发事故有监控记录），部分地区社保部门可能允许在工伤认定申请时同步提交停工留薪期申请，但最终仍需以工伤认定结论为依据。

3. 劳动仲裁中的合并处理

• 仲裁请求的合并：若劳动者在劳动仲裁中同时主张确认劳动关系、要求用人单位配合工伤认定及支付停工留薪期工资，仲裁委可能合并审理，但需注意：
  1. 仲裁委无权直接认定工伤：工伤认定属于社保部门的行政职权，仲裁委仅能裁决用人单位配合申请工伤认定（如提供材料、出具证明等）。
  2. 停工留薪期工资需以工伤认定为前提：若仲裁时工伤认定尚未完成，仲裁委可能暂不处理停工留薪期工资请求，待工伤认定后另行主张。

4. 实务建议

• 步骤一：优先确认劳动关系：若劳动关系存在争议，立即申请劳动仲裁，同时收集工伤证据（如医疗记录、证人证言等）。
• 步骤二：同步申请工伤认定：在仲裁确认劳动关系后，或劳动关系无争议时，尽快向社保部门提交工伤认定申请（需在事故发生后1年内提出）。
• 步骤三：申请停工留薪期确认：工伤认定后，向劳动能力鉴定委员会申请停工留薪期确认，并据此要求用人单位支付工资。
• 例外情形：若用人单位未在30日内申请工伤认定，劳动者可自行申请，此时可同步要求用人单位支付停工留薪期工资（若能证明工伤事实）。

示例：
劳动者小王在工作中受伤，但未签劳动合同。他可先申请劳动仲裁确认与公司的劳动关系，同时收集医疗记录、工友证言等证据。仲裁确认劳动关系后，小王立即向社保部门申请工伤认定，并在认定后申请停工留薪期确认，最终要求公司支付治疗期间的工资。

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