产假期间公司员工有生育津贴但不发工资是否合法，主要取决于公司是否为女职工缴纳了生育保险，以及生育津贴的数额与女职工正常工资的比较情况。以下是详细分析：
一、公司缴纳了生育保险的情况
合法性：
- 如果公司已经为女职工缴纳了生育保险，根据《女职工劳动保护特别规定》和《中华人民共和国社会保险法》，女职工在产假期间，公司无需再向其支付原工资，而是应凭女职工的生育凭证到生育保险基金处为其申请生育津贴，作为女职工产假期间的工资性补偿。
生育津贴与工资的对比：
- 生育津贴的数额通常按照用人单位上年度职工月平均工资的标准计算。若此津贴等于或高于女职工正常出勤期间的工资，公司只需发放生育津贴即可，无需额外支付工资。
- 若生育津贴低于女职工正常出勤期间的工资，从保障女职工权益角度出发，公司理论上需要补足差额（不过具体实践中需结合地方规定等），确保女职工产假期间的实际收入不降低。例如，若女职工产假前月工资为8000元，而生育津贴仅为6000元，则公司应补足2000元的差额。
生育津贴的性质：
- 生育津贴不是直接的产假工资，而是由社会保险机构发放给用人单位的工资性补偿，再由用人单位支付给生育女职工。
二、公司未缴纳生育保险的情况
- 不合法性：
- 如果公司没有为女职工缴纳生育保险，那么根据《女职工劳动保护特别规定》第八条，产假期间公司应当按照女职工产假前的工资标准支付工资。此时，如果公司只发生育津贴而不发工资，则是违法的。
三、法律建议与维权途径
了解自身权益：
- 女职工应了解自己的权益，包括产假期间的工资或生育津贴的发放标准。
与公司协商：
- 如果发现公司未按规定发放工资或生育津贴，应首先尝试与公司进行友好协商，要求其按照法律规定处理。
向劳动监察部门投诉：
- 如果协商不成，可以向当地的劳动监察部门投诉，请求其对用人单位进行调查和处理。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 在必要时，还可以向劳动人事争议调解仲裁机构申请调解仲裁，甚至向人民法院提起诉讼以维护自己的权益。
总结来说，产假期间公司是否可以只发生育津贴不发工资，需根据公司是否为女职工缴纳了生育保险以及生育津贴与女职工正常工资的比较情况来确定。女职工应了解自己的权益，并在必要时采取合适的维权措施。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。