结论：公司扣除员工因上班路上被车撞（本人负主要责任）而休息的工资和全勤奖，一般是不合理的。以下从不同角度进行分析：

一、工伤认定与工资福利

1. 工伤认定：

   • 根据《工伤保险条例》第十四条，职工在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故或者城市轨道交通、客运轮渡、火车事故伤害的，应当认定为工伤。但在此案例中，员工本人负主要责任，因此不符合工伤认定的条件。

2. 工资福利：

   • 尽管员工在此次事故中不符合工伤认定条件，但公司扣除其休息期间的工资和全勤奖仍需谨慎考虑。工资是员工因提供劳动而获得的报酬，全勤奖则是公司对员工全勤工作的奖励。在员工因非自身原因（如交通事故，尽管负主要责任）导致无法全勤或提供劳动的情况下，公司单方面扣除工资和全勤奖可能缺乏合理性。

二、公司规章制度与劳动合同

1. 公司规章制度：

   • 公司规章制度应当合法、合理，且不得违反法律法规的强制性规定。如果公司规章制度中明确规定，员工在上下班途中发生交通事故（无论责任大小）导致无法全勤或提供劳动的，公司有权扣除其工资和全勤奖，那么这样的规定可能因违反法律法规的公平、合理原则而无效。

2. 劳动合同：

   • 劳动合同是员工与公司之间约定劳动权利和义务的协议。如果劳动合同中没有明确约定员工在上下班途中发生交通事故导致无法全勤或提供劳动时，公司可以扣除其工资和全勤奖，那么公司单方面扣除可能构成违约。

三、法律建议

1. 与公司协商：

   • 员工可以与公司进行协商，说明自己因交通事故导致无法全勤或提供劳动的情况，并请求公司恢复其工资和全勤奖的发放。

2. 申请劳动仲裁：

   • 如果协商无果，员工可以向当地劳动仲裁机构申请劳动仲裁，要求公司恢复其工资和全勤奖的发放，并可能要求公司支付因扣除工资和全勤奖而造成的经济损失。

3. 寻求法律援助：

   • 在申请劳动仲裁过程中，员工可以寻求法律援助或咨询专业律师，以更好地维护自己的合法权益。

后续行动建议：员工在处理此类问题时，应保留好相关证据（如交通事故认定书、医院诊断证明、工资条等），以便在协商或劳动仲裁过程中证明自己的主张。同时，员工也应了解自己的劳动合同和公司规章制度中关于工资和全勤奖的相关规定，以便更好地维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。