结论：银行卡逾期后协商还款已还完，能否申请把部分利息和违约金要求银行退还，这主要取决于贷款合同的具体条款、银行的相关政策以及协商的结果，存在退还的可能性，但并非绝对。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与合同条款
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，借款人应当按照约定的期限返还借款，并支付约定的利息。若借款人未按照约定履行还款义务，银行有权要求借款人支付逾期利息和违约金。
- 同时，民法典也强调了公平原则和诚实信用原则，这为借款人与银行之间的协商提供了法律基础。
合同条款：
- 贷款合同中通常会明确约定利息、违约金的计算方式和支付条件。若合同中有关于减免利息或违约金的条款，借款人可以依据合同条款向银行提出申请。
- 若合同中没有明确约定，借款人仍可以尝试与银行进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。
二、协商退还的可能性与操作
协商的基础：
- 银行在借款人逾期后，虽然有权要求借款人支付逾期利息和违约金，但并不意味着银行不会考虑借款人的实际情况和还款意愿。
- 在实际情况中，银行往往愿意与借款人进行协商，以寻求双方都能接受的解决方案，如减免部分利息或违约金、延期还款等。
协商的内容与操作：
- 借款人可以主动联系银行，说明自己的实际情况和还款意愿，并提出协商退还部分利息和违约金的请求。
- 为了支持自己的协商请求，借款人可以提供相关证据，如收入证明、医疗证明等，以证明自己确实存在还款困难。
- 银行在收到借款人的协商请求后，会进行内部审核，并根据借款人的实际情况和银行政策作出回复。若银行同意协商退还部分利息和违约金，双方应签订新的还款协议，并明确退款的具体金额和时间。
三、可能的结果与后续行动
可能的结果：
- 若银行同意协商退还部分利息和违约金，借款人将按照新的还款协议进行还款，并获得相应的退款。
- 若银行不同意协商退还，借款人仍需按照原贷款合同的约定履行还款义务，包括支付逾期利息和违约金。
后续行动：
- 若协商成功，借款人应严格按照新的还款协议履行还款义务，避免再次逾期。
- 若协商失败，借款人可以考虑通过法律途径解决纠纷，如向法院提起诉讼或申请仲裁。但在此之前，建议借款人再次与银行进行沟通，寻求其他可能的解决方案。
建议：在协商过程中，借款人应保持冷静和理性，充分表达自己的还款意愿和困难，并尝试与银行达成双方都能接受的解决方案。若协商无果，可以寻求专业法律人士的帮助，以维护自己的合法权益。有问题可以直接向我咨询，我会结合你的具体情况提供更详细的法律建议。