公司有权设置多层审批流程，但需满足合法性与合理性要求。以下从法律角度详细分析：

1. 法律未禁止多层审批，但需符合程序正当性
   根据《劳动合同法》第三十七条，劳动者提前30日书面通知用人单位即可解除劳动合同（试用期提前3日）。法律未限制公司审批流程的层级数量，但公司设置的流程需满足：
   

• 不违反强制性规定：例如不得要求劳动者支付违约金（除服务期或竞业限制情形外）；
  
• 不恶意拖延：若公司以“未审批通过”为由拒绝劳动者离职，可能构成违法。劳动者在法定通知期满后即可离职，公司需配合办理手续。

1. 多层审批的合理性边界
   公司可基于管理需要设置审批流程，但需平衡效率与劳动者权益：
   

• 合理情形：如涉及重要岗位交接、商业秘密保护或项目关键期，公司可要求多层级确认；
  
• 不合理情形：若审批流程冗长（如超过30日）、要求劳动者反复提交材料或设置与离职无关的条件（如完成非本职工作），可能被认定为变相阻碍离职，劳动者可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

1. 劳动者应对建议
   

• 书面留痕：提交离职申请时使用邮件、书面函件等可证明送达的方式，并注明“根据《劳动合同法》第三十七条，提前30日通知解除劳动合同”；
  
• 保留证据：若公司拖延审批，可保存沟通记录（如微信、邮件）作为证据；
  
• 依法离职：通知期满后，无论公司是否审批，劳动者均可离职。若公司拒不办理手续，可申请劳动仲裁要求出具离职证明、转移社保等。

总结：公司可设置多层审批，但不得违反法律强制性规定或恶意拖延。劳动者需注意程序合法性，必要时通过法律途径维护权益。如有具体案例或细节需要分析，可直接向我咨询。