被公司辞退后，即使工资已结清，您仍然有权申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。以下是对此问题的详细解析：

1. 核心结论与法律依据

根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条的规定，因除名、辞退和辞职、离职发生的争议明确属于劳动争议仲裁的受案范围。这意味着，无论公司是否已结清工资，只要您认为公司的辞退行为存在违法或不当之处，都可以依法向劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请。

1. 常见可申请仲裁的情况

   • 违法解除劳动合同：若公司无正当理由或违反《劳动合同法》规定辞退您，如女职工在孕期、产期、哺乳期被违法辞退，您可以要求公司支付违法解除劳动合同的赔偿金。赔偿标准通常按工作年限每满一年支付两个月工资。
   • 未支付经济补偿：当公司因符合法律规定的情形辞退您，但未按规定支付经济补偿时，您可以通过仲裁主张经济补偿。补偿标准按您在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资。
   • 存在争议的解除理由：如果公司提出的辞退理由存在争议，且没有充分证据证明您不能胜任工作，也未按照法律规定进行培训或调岗，您同样可以申请仲裁来争取自己的权益。

2. 申请条件与流程

   • 时效要求：您需要在公司辞退后一年内向劳动仲裁机构提出申请，仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
   • 证据准备：您应准备好相关证据，包括劳动合同、工资条、工作证、考勤记录、辞退通知等，以证明与公司存在劳动关系以及辞退的相关事实。
   • 申请流程：
     • 提交书面仲裁申请，并填写相关表格，说明仲裁请求和事实理由。
     • 劳动仲裁机构进行立案审查，并在5个工作日内给予是否立案的答复。
     • 立案后，双方进入举证期，并安排开庭审理，进行陈述、质证和辩论。
     • 审理结束后，劳动仲裁机构进行调解，若调解不成功则下达裁决书。该裁决对双方当事人均具有法律约束力，若用人单位不履行裁决，您可向人民法院申请强制执行。

3. 注意事项

   • 在申请劳动仲裁前，建议您先与公司进行协商，尝试通过和解的方式解决争议。
   • 提供的证据必须充分、真实，以支持自己的主张。
   • 若对劳动仲裁机构的裁决不服，您还可以向人民法院提起诉讼，但在此之前必须经过劳动仲裁程序。

举例说明：假设您因公司无故辞退而申请仲裁，且您在公司工作了3年，月工资为5000元。若公司被认定为违法解除劳动合同，则您可能获得的赔偿金为：3年×2个月/年×5000元/月=30000元。

综上所述，即使工资已结清，您仍然有权就公司的辞退行为申请劳动仲裁。在申请过程中，请务必遵守相关法律法规和仲裁机构的规定，以确保自己的权益得到有效维护。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。