结论前置：工厂规定旷工三天算自动离职是否合法，主要取决于该规章制度是否合法有效且明确规定了旷工三天的后果。若规章制度合法有效且明确规定了旷工三天的处理方式，则公司可据此解除劳动合同；否则，公司不能随意将旷工三天的员工视为自动离职。

一、法律层面分析

1. 法律无明确规定：我国法律并未明确统一规定旷工多少天即构成自动离职。自动离职在法律上并非规范表述，而是一般指劳动者不告而别、无故旷工达到一定合理期限，并表现出不再继续履行劳动合同的意思。因此，不能简单地将旷工三天与自动离职划等号。

2. 用人单位规章制度制定权：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位有权制定规章制度，但这些规章制度必须符合法律规定，不得违反法律法规的强制性规定，且需经过民主程序制定并向劳动者公示。这意味着，如果工厂的规章制度中明确规定了旷工三天的处理方式，并且该规章制度是合法有效的，那么工厂可以依据该规章制度来处理旷工三天的员工。

二、用人单位规章制度分析

1. 规章制度内容：工厂的规章制度中可能会规定，连续旷工3天或累计旷工达到一定天数（如15天）可视为严重违纪行为，并作为解除劳动合同的情形之一。这一规定必须合法、合理且经过公示，才能对员工产生约束力。

2. 规章制度有效性条件：

   • 内容合法合理：规章制度的内容必须符合法律法规的规定，不得违反法律法规的强制性规定，同时应符合企业管理逻辑和公平原则。
   • 经过民主程序制定：规章制度通常需要经过职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定。这是确保规章制度民主性和合法性的重要步骤。
   • 已向劳动者公示：工厂需要通过发放员工手册、组织培训、公告栏张贴等方式，确保员工知晓规章制度的内容。如果员工不知道规章制度的存在或内容，那么该规章制度对员工不产生约束力。

三、自动离职的定义与后果

1. 定义：自动离职通常指劳动者未提前通知用人单位，擅自离开工作岗位并强行解除劳动关系的行为。这种行为可能给用人单位带来损失，因此用人单位有权根据规章制度对自动离职的员工进行处理。

2. 后果处理：若员工被认定为自动离职，工厂应依法妥善处理相关手续及工资结算等问题。工厂不得随意克扣员工工资或拒绝支付应得的劳动报酬。如果工厂违反规定处理自动离职的员工，员工有权通过法律途径维护自己的合法权益。

四、实际应用中的分析与建议

1. 对于劳动者：

   • 应严格遵守工厂的规章制度，按时出勤，以维护自身的合法权益。如果因特殊原因需要请假或旷工，应及时与工厂沟通并说明情况。
   • 若认为工厂规章制度中存在不合理或不合法的条款，有权向相关部门投诉或寻求法律援助。在维护自身权益的同时，也应尊重工厂的合法权益和管理秩序。

2. 对于工厂：

   • 应制定合法有效的规章制度，并确保其内容合理、经过民主程序制定且已向劳动者公示。这是确保规章制度对员工产生约束力的前提。
   • 在处理旷工问题时，应依据规章制度进行，避免违法解除劳动合同的法律风险。如果工厂随意解除劳动合同或违反规定处理员工，可能面临法律诉讼和赔偿等风险。

五、具体案例与法律后果

假设某工厂的规章制度中明确规定了“连续旷工3天视为严重违纪行为，工厂有权解除劳动合同”，并且该规章制度已经过民主程序制定且向劳动者公示。如果某员工连续旷工3天，那么工厂可以依据该规章制度解除与该员工的劳动合同。但是，如果工厂没有制定这样的规章制度或者规章制度未经过民主程序制定或未向劳动者公示，那么工厂就不能随意解除与该员工的劳动合同。

总结：旷工三天是否算自动离职，关键在于工厂的规章制度是否有明确规定，且该规定是否合法有效。劳动者和工厂都应充分了解相关法律法规和规章制度，以确保自身权益得到妥善保护。如果您有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。