证券公司检查员工手机微信是否违法，不能一概而论，需要分情况讨论：
公司规章制度与劳动合同约定
- 如果证券公司的规章制度或劳动合同中明确规定了公司有权检查员工手机微信，并且这一规定不违反法律法规的强制性规定，同时员工在入职时已经明确知晓并同意这一条款，那么公司在特定情况下（如怀疑员工存在违规行为、泄露公司机密等）检查员工手机微信，可能不构成违法。但即便如此，公司也应尊重员工的隐私权，避免过度侵犯。
- 法律依据：根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项。然而，这并不意味着用人单位可以无限制地侵犯劳动者的隐私权。
未经同意的检查行为
- 如果证券公司未经员工同意，擅自检查员工手机微信，这很可能构成对员工隐私权的侵犯。员工的微信聊天记录属于其个人隐私范畴，未经本人同意，他人不得非法获取或查看。
- 法律后果：根据《民法典》中关于隐私权保护的规定，侵犯他人隐私权的，应当承担侵权责任，包括停止侵害、赔礼道歉、赔偿损失等。如果公司的行为构成对员工隐私权的严重侵犯，员工还可以向相关部门投诉或提起诉讼。
特殊情况下的检查
- 在某些特殊情况下，如员工涉嫌违法犯罪、严重违反公司规章制度或给公司造成重大损失等，公司可能需要在法律允许的范围内进行调查。但即便如此，公司也应遵循合法、正当、必要的原则，避免过度侵犯员工的隐私权。
- 建议操作：在这种情况下，公司最好先咨询法律专业人士的意见，确保调查行为的合法性和合规性。同时，公司应尽可能通过合法途径获取证据，如要求员工配合调查、提供相关证据等。
给证券公司的建议：
- 完善规章制度：证券公司应制定完善的规章制度，明确员工在使用公司设备或网络时的行为规范，以及公司在特定情况下的调查权限和程序。
- 尊重员工隐私：公司在行使调查权时，应尊重员工的隐私权，避免过度侵犯。如果需要检查员工手机微信等个人设备，应事先征得员工同意，并确保检查行为的合法性和合规性。
- 加强法律培训：证券公司应加强对员工的法律培训，提高员工的法律意识和合规意识，避免因违规行为而给公司带来法律风险。
给员工的建议：
- 了解公司规章制度：员工在入职时应仔细阅读公司的规章制度和劳动合同，了解公司在调查员工行为方面的权限和程序。
- 保护个人隐私：员工应妥善保管自己的个人设备，避免将公司机密或个人隐私信息泄露给无关人员。如果公司要求检查个人设备，员工有权要求公司说明检查的理由和依据，并在必要时寻求法律帮助。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。