结论前置：在合同已约定纠纷仲裁的情况下，补充协议能否用来起诉需分情况讨论，若补充协议变更了原合同的争议解决方式为诉讼，且变更有效，则可以用补充协议起诉；若补充协议未变更或变更无效，则仍需仲裁。以下为详细分析：
一、补充协议变更原合同争议解决方式为诉讼且变更有效的情况
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》第五百四十三条：“当事人协商一致，可以变更合同。”这意味着，如果双方当事人在补充协议中明确变更了原合同中的争议解决方式，从仲裁变更为诉讼，且这种变更是双方真实意思的表示，不违反法律、行政法规的强制性规定，也不违背公序良俗，那么这种变更是有效的。
实际操作：
- 在这种情况下，如果双方因合同产生纠纷，一方选择依据补充协议中的诉讼条款向法院提起诉讼，法院是会受理的。因为此时，补充协议中的争议解决方式已经取代了原合同中的仲裁条款，成为双方解决纠纷的新约定。
示例：
- 假设甲乙双方签订了一份买卖合同，约定纠纷由仲裁机构仲裁。后来，双方又签订了一份补充协议，明确约定：“因本合同产生的任何纠纷，双方同意提交至有管辖权的人民法院诉讼解决。”在这种情况下，如果双方因合同产生纠纷，甲或乙就可以依据补充协议向法院提起诉讼。
二、补充协议未变更或变更原合同争议解决方式无效的情况
法律依据：
- 如果补充协议没有变更原合同中的争议解决方式，或者变更无效（如变更内容违反法律、行政法规的强制性规定，或违背公序良俗），那么原合同中的仲裁条款仍然有效。
实际操作：
- 在这种情况下，如果双方因合同产生纠纷，一方选择向法院提起诉讼，而另一方提出仲裁异议，法院会审查补充协议的内容。如果发现补充协议没有变更或变更无效，法院会裁定驳回起诉，并告知双方按照原合同中的仲裁条款申请仲裁。
示例：
- 假设甲乙双方签订了一份买卖合同，约定纠纷由仲裁机构仲裁。后来，双方又签订了一份补充协议，但补充协议中并没有提及争议解决方式的变更。或者，补充协议中虽然提及了变更，但变更内容违反了法律、行政法规的强制性规定。在这种情况下，如果双方因合同产生纠纷，甲或乙就不能依据补充协议向法院提起诉讼，而应该按照原合同中的仲裁条款申请仲裁。
建议：在签订补充协议时，如果双方希望变更原合同中的争议解决方式，一定要明确、具体地写明变更内容，并确保变更内容合法、有效。如果对变更的合法性、有效性有疑问，建议咨询专业律师，以避免后续纠纷。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。