协议约定可向双方住所地法院起诉，在符合一定条件下是有效的。以下是对这一问题的详细分析：

一、法律依据与合法性基础

根据《中华人民共和国民事诉讼法》第三十五条的规定，合同或者其他财产权益纠纷的当事人可以书面协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖，但不得违反本法对级别管辖和专属管辖的规定。因此，从法律层面看，双方住所地作为与争议有实际联系的地点，其约定在一般情况下是允许的，具有合法性基础。

二、约定有效的具体条件

1. 明确性：

   • 合同中应明确约定“双方住所地”的具体含义，是指户籍所在地、经常居住地还是其他具体地址。避免使用模糊语言，以确保约定的明确性。

2. 唯一确定性：

   • 协议管辖必须具有唯一确定性。如果约定可能导致两个以上法院都有管辖权，且无法确定具体的管辖法院，该约定可能会被认定为无效。例如，当合同双方分别位于不同省份时，应进一步明确具体由哪个法院管辖，以避免管辖混乱。

3. 不违反级别管辖和专属管辖：

   • 即使合同约定了双方住所地起诉，但如果案件涉及专属管辖的情形（如不动产纠纷由不动产所在地人民法院管辖），或者违反了级别管辖的规定（如将基层人民法院管辖的案件约定为中级人民法院管辖），那么该约定也是无效的。

三、约定无效的法律后果

若协议约定因违反上述条件而被认定为无效，则需根据民事诉讼法的一般规定来确定管辖法院。通常情况下，被告住所地或合同履行地人民法院对合同纠纷案件有管辖权。如无明确履行地，则根据争议标的性质确定合同履行地（如给付货币则为接收货币一方所在地，交付不动产则为不动产所在地等）。

四、实际操作建议

1. 明确约定管辖法院：

   • 在签订合同时，双方应仔细考虑并明确约定管辖法院，确保约定的明确性和唯一确定性。避免使用模糊语言或可能导致管辖混乱的条款。

2. 遵守级别管辖和专属管辖规定：

   • 确保约定不违反级别管辖和专属管辖的规定。对于涉及专属管辖的案件，如不动产纠纷、港口作业纠纷等，应按照法定专属管辖法院进行诉讼。

3. 咨询专业律师（此处在优化时调整为直接向用户提供咨询引导）：

   • 在签订合同或面临管辖权争议时，如有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询，以确保合同的合法性和有效性，并有效避免未来纠纷和风险。

五、实例说明

假设甲乙双方签订了一份买卖合同，并在合同中约定：“如双方在本合同履行过程中发生争议，协商不成的，任何一方均有权向自己住所地的人民法院提起诉讼。”若该约定明确、具体，且不违反级别管辖和专属管辖的规定，则该约定是有效的。在合同违约时，甲方或乙方均可根据自己住所地选择相应的法院提起诉讼。

综上所述，协议约定可向双方住所地法院起诉在符合一定条件下是有效的。双方在签订合同时应特别注意约定的明确性、唯一确定性以及遵守级别管辖和专属管辖的规定。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。