在建设工程领域，若甲方只认公司不认实际施工人，实际施工人可以通过以下途径来维护自己的合法权益：

1. 明确合同关系与实际施工情况：

   • 首先，需要梳理清楚实际施工人与公司之间的合同关系，包括是否签订了书面合同、合同的具体内容、实际施工的范围和工程量等。
   • 同时，收集能够证明实际施工人实际参与了工程建设的相关证据，如施工日志、现场照片、材料采购单据、工人工资发放记录等。

2. 与公司协商并寻求支持：

   • 实际施工人可以与公司进行协商，要求公司出面与甲方沟通，确认实际施工人的身份和权益。
   • 如果公司愿意支持实际施工人，可以共同向甲方出具书面说明或证明，明确实际施工人的地位和应得的权益。

3. 利用法律途径维护权益：

   • 如果实际施工人与公司之间存在合法的分包或转包关系：根据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释，实际施工人有权在特定条件下直接向发包人（即甲方）主张工程款。这通常发生在公司因各种原因无法履行支付义务时，实际施工人可以突破合同相对性，直接向甲方追讨工程款。但需要注意的是，这种权利的行使通常受到一定条件的限制，如实际施工人需证明其与发包人之间存在事实上的合同关系，且发包人欠付工程款等。
   • 如果实际施工人与公司之间不存在合法的分包或转包关系，而是挂靠或借用资质等情形：这种情况下，实际施工人的权益保护可能更为复杂。因为挂靠或借用资质等行为本身可能违反法律法规，实际施工人可能难以直接通过法律途径向甲方主张权益。此时，实际施工人可能需要先与公司解决内部纠纷，如要求公司承担违约责任或赔偿损失等。
   • 提起诉讼或仲裁：在协商无果的情况下，实际施工人可以考虑通过法律途径解决纠纷。如果合同中有仲裁条款，则应按照仲裁条款的约定向仲裁机构申请仲裁；如果没有仲裁条款或仲裁条款无效，则可以向有管辖权的人民法院提起诉讼。在诉讼或仲裁过程中，实际施工人需要充分举证证明自己的实际施工情况和应得的权益。

4. 注意证据收集和保存：

   • 在整个过程中，实际施工人应特别注意证据的收集和保存。证据是维护权益的关键，只有充分、有效的证据才能支持实际施工人的主张。
   • 证据可以包括书面合同、施工日志、现场照片、材料采购单据、工人工资发放记录、与公司或甲方的沟通记录等。

5. 寻求专业法律帮助：

   • 由于建设工程领域的法律关系复杂且涉及金额较大，实际施工人在维护权益时可能会遇到诸多困难。因此，建议实际施工人在必要时寻求专业律师的帮助，以便更好地了解自己的权益和维权途径。

在实际操作中，每个案件的具体情况都有所不同。因此，实际施工人在遇到类似问题时，应根据自己的实际情况和合同条款来具体分析并采取相应的措施。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。