存在有效的合伙协议中的仲裁条款或单独达成的仲裁协议时，合伙纠纷可以申请仲裁。以下是对此问题的详细分析：
一、仲裁协议的有效性
形式要求：
- 仲裁协议必须以书面形式存在，这包括在合伙协议中明确约定的仲裁条款，或者纠纷发生前、后单独达成的书面请求仲裁的协议。根据《中华人民共和国仲裁法》第十六条，口头约定的仲裁协议是无效的。
内容要求：
- 双方当事人需明确表示愿意将合伙纠纷提交仲裁解决，即具有请求仲裁的意思表示。
- 仲裁事项应具体明确，如合伙期间的利润分配、退伙等争议范围需在协议中清晰界定。
- 选定的仲裁委员会必须明确，因为不同仲裁委员会在规则、仲裁员等方面存在差异，需确保双方对受理机构有一致认识。
二、仲裁的适用性
可仲裁事项：
- 合伙纠纷通常涉及合同纠纷和其他财产权益纠纷，根据《中华人民共和国仲裁法》第二条，这类纠纷是可以仲裁的。
不可仲裁事项排除：
- 根据《中华人民共和国仲裁法》第三条，婚姻、收养、监护、扶养、继承纠纷以及依法应由行政机关处理的行政争议不得仲裁。合伙纠纷不属于这些范畴，因此可以仲裁。
三、仲裁的优势与注意事项
优势：
- 专业性：仲裁机构由具有专业法律知识或商业经验的人士组成，能够更准确地理解和审理涉及合伙的复杂商业纠纷。
- 保密性：仲裁程序不公开进行，有助于保护合伙企业的商业秘密和合伙人的个人隐私。
- 快捷性：仲裁程序相对灵活且高效，通常能更快地作出裁决，减少时间成本。
- 终局性：仲裁裁决一般具有终局性，即一裁终局，除非存在法定可撤销或不予执行的情形。
注意事项：
- 费用问题：仲裁费用相对较高，包括仲裁受理费和仲裁员报酬等，需根据标的额合理评估成本。
- 执行问题：若对方不履行仲裁裁决，可能需要通过法院强制执行，但整体上执行效率仍高于诉讼。
四、实际操作建议
- 检查合伙协议：首先检查合伙协议中是否包含有效的仲裁条款，或者是否在纠纷发生后达成了有效的仲裁协议。
- 选择仲裁委员会：如果决定仲裁，需明确选定一个存在的、能够确定的仲裁委员会，并按照该委员会的规定提交仲裁申请。
- 准备仲裁材料：仲裁申请书应载明申请人和被申请人的基本情况、仲裁请求、所根据的事实和理由、证据和证据来源、证人姓名和住所等事项。
- 预交仲裁费用：按照选定仲裁委员会的要求，预交相应的仲裁费用。
综上所述，如果合伙协议中存在有效的仲裁条款或单独达成了有效的仲裁协议，且纠纷属于可仲裁事项，那么合伙纠纷是可以申请仲裁的。在实际操作中，建议仔细检查合伙协议、选择合适的仲裁委员会、准备充分的仲裁材料，并预交仲裁费用。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。