结论：该协议是否有效，需结合具体情况判断，若协议内容合法、双方自愿且不违反强制性规定，则有效；若存在违法情形或显失公平，则可能无效或部分无效。以下从不同角度详细分析：
一、协议有效的情形
双方自愿签订且内容合法：
- 若您与学校在平等、自愿的基础上签订了该协议，且协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么该协议是有效的。这意味着，如果您在获取职称后的3年内辞职，确实需要按照协议约定向学校支付3万元的违约金。
学校提供了特殊待遇或投入：
- 如果学校在您获取职称的过程中提供了特殊的培训、资源投入或福利待遇，且这些投入是超出常规的，那么学校通过协议约定一定的服务期和违约金是合理的。这种情况下，协议的有效性更容易得到法律的支持。
二、协议可能无效或部分无效的情形
违反法律强制性规定：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者约定由劳动者承担违约金的情形仅限于两种：一是用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训，并约定服务期的；二是用人单位与劳动者约定竞业限制条款的。若学校与您签订的协议不属于这两种情形之一，且约定了违约金，则该约定可能因违反法律强制性规定而无效。
显失公平或存在欺诈、胁迫：
- 如果协议在签订时存在显失公平的情况，比如学校利用优势地位迫使您签订不合理的条款，或者协议内容存在欺诈、胁迫等情形，那么您有权请求人民法院或仲裁机构变更或撤销该协议。在这种情况下，协议可能被认定为部分或全部无效。
违约金数额过高：
- 即使协议在形式上合法，但如果约定的违约金数额过高，远远超过了学校实际遭受的损失，那么根据法律规定，人民法院或仲裁机构可能会根据当事人的请求予以适当减少。这意味着，即使您需要支付违约金，也可能不需要支付全额的3万元。
三、法律建议
审查协议内容：
- 建议您仔细审查与学校签订的协议内容，特别是关于违约金的条款。确认协议是否属于法律允许的约定违约金的情形，以及违约金数额是否合理。
咨询专业意见：
- 如果您对协议的有效性或违约金数额有疑问，建议您咨询专业的法律人士，比如向我咨询。我可以根据您的具体情况和协议内容，为您提供更详细的法律分析和建议。
协商解决：
- 如果您确实希望辞职，但担心违约金问题，可以尝试与学校进行协商。通过友好沟通，双方可能能够达成一个更合理的解决方案，比如减少违约金数额或延长服务期等。
准备应对法律纠纷：
- 如果协商无果，且您认为协议存在无效或可撤销的情形，那么您需要做好应对法律纠纷的准备。这包括收集证据、准备法律文件等。在这种情况下，寻求专业法律人士的帮助将是非常重要的。