旷工三天不算自离不给工资是不合法的。
分析说明：
劳动者权益：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。劳动者为用人单位提供了劳动，就有获得劳动报酬的权利，即使旷工，用人单位也不能因此剥夺劳动者获取劳动报酬的法定权利。
旷工处理：虽然旷工属于违反用人单位规章制度的行为，但用人单位在处理旷工员工时，应依法进行。如果用人单位的规章制度中明确规定了旷工的处理方式，并且该规章制度已经过合法程序制定并向劳动者公示，那么用人单位可以按照规章制度处理。但无论如何，用人单位都不能随意克扣劳动者的工资。
工资支付：用人单位应当按照劳动者实际工作天数支付工资。如果劳动者旷工三天后自行离职，用人单位应当支付劳动者实际工作天数的工资。如果用人单位拒绝支付，劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
法律建议：
与用人单位协商：首先尝试与用人单位沟通，明确表明自己虽然旷工，但依法仍有权获得已工作天数的劳动报酬，看是否能够协商解决。
准备证据：如果协商无果，准备好相关证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等，以证明自己在单位的工作情况以及旷工的具体情况。
投诉或仲裁：向当地的劳动监察部门进行投诉，或者申请劳动仲裁，要求用人单位支付拖欠的工资。如果对劳动仲裁的结果不满意，还可以在规定的时间内向人民法院提起诉讼。
综上所述，旷工三天不算自离不给工资是不合法的行为。劳动者在维护自身权益时，应采取合法途径并准备好相关证据，确保自己的合法权益得到有效保障。如果你在这个过程中遇到任何问题，可以直接向我咨询。