公司辞退员工时只按底薪赔偿，这一做法通常是不合法的。以下是从不同角度的详细分析：
一、法律依据与解释
工资总额组成：
- 根据《关于工资总额组成的规定》，工资总额包括计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、加班加点工资以及特殊情况下支付的工资。因此，劳动者的月工资不仅指底薪，还包括其他应得收入，如绩效工资、奖金等。
经济补偿计算：
- 依据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。这里的“工资”指的是劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资，包含底薪以外的其他收入部分。
- 如果公司仅按底薪计算经济补偿，显然违反了上述规定，因为底薪只是工资总额的一部分，不能代表劳动者的实际月工资水平。
违法辞退的后果：
- 若用人单位违法辞退员工，即无合法解雇理由或未遵循法定程序，除需支付实际工作工资外，还需按经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。这进一步强调了经济补偿应基于劳动者的实际工资水平，而非仅底薪。
二、实际操作中的注意事项
明确工资构成：
- 在辞退员工前，用人单位应清晰界定员工的工资构成，确保所有应得部分都被纳入考虑范围。这包括底薪、绩效工资、奖金、津贴等所有组成部分。
遵循法定程序：
- 用人单位在辞退员工时，必须严格遵守法定程序和条件。例如，需提前通知员工、说明辞退理由、办理离职手续等。以保护员工的合法权益不受侵害。
及时支付工资与经济补偿：
- 解除或终止劳动合同后，用人单位应立即支付员工应得的工资和经济补偿金。无故拖延或仅按底薪支付都是违法的。
三、特殊情况说明
尽管一般情况下按底薪赔偿不合法，但也存在例外情况。如果劳动合同中明确约定在某些特定情形下（如辞退时）工资或经济补偿仅按底薪计算，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，同时用人单位能证明该约定的合理合法性（例如基于公平合理的绩效考核制度），这样的约定可能被视为有效。然而，这种情况较为罕见，且需要严格的法律审查和证据支持。
四、员工应对措施
查阅劳动合同：
- 员工在认为公司行为侵害自身权益时，应首先查阅劳动合同中的相关约定，确认公司行为是否违法。
与公司协商：
- 尝试与公司进行协商，要求公司按照法律规定支付应得的工资和经济补偿金。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 如协商无果，员工可向劳动监察部门投诉，申请劳动仲裁，或在必要时提起诉讼，要求公司足额支付工资并主张经济补偿。
总结来说，公司辞退员工时只按底薪赔偿通常是不合法的。员工在面对此类情况时，应充分了解自身权益和法律规定，采取适当的应对措施以保护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。