不能证明标的物来源的合法性，并不意味着整个合同都是无效的。这一结论的得出，需要我们从多个角度进行深入分析：
合同效力的基本原则：
- 合同的效力主要取决于合同双方的意思表示是否真实、合法，以及合同内容是否违反法律、行政法规的强制性规定或公序良俗。标的物来源的合法性，虽然是合同履行中的一个重要方面，但它并不直接决定合同的效力。
标的物来源合法性的影响：
- 如果标的物来源不合法，这可能会影响到合同的履行，比如导致合同无法实际履行或履行后产生法律纠纷。但这并不等同于合同本身无效。合同无效通常指的是合同自始不具有法律效力，比如因为合同内容违法、双方意思表示不真实等原因。
- 在某些特定情况下，如果标的物的非法性直接违反了法律的强制性规定，且这种违法性是合同目的或主要内容的一部分，那么合同可能会被认定为无效。但这需要具体分析合同的具体内容和标的物的性质。
合同无效的法定情形：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同无效的情形主要包括：无民事行为能力人实施的民事法律行为、以虚假的意思表示实施的民事法律行为、违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为（但并非所有违反强制性规定的合同都无效，需具体分析）、违背公序良俗的民事法律行为、行为人与相对人恶意串通，损害他人合法权益的民事法律行为等。
- 标的物来源不合法，并不直接对应上述任何一种合同无效的情形。因此，不能仅凭标的物来源不合法就断定整个合同无效。
实际案例与司法实践：
- 在司法实践中，法院在判断合同效力时，会综合考虑合同的具体内容、双方的意思表示、标的物的性质以及相关法律法规的规定。即使标的物来源存在合法性问题，法院也会根据具体情况来判断是否影响合同的效力。
建议：
- 如果您在合同中遇到了标的物来源合法性的问题，首先不要惊慌，这并不意味着整个合同就无效了。
- 您应该仔细审查合同的具体内容，了解标的物的性质以及相关法律法规的规定。
- 如果可能的话，咨询专业的法律人士（比如我，林丽律师，专注于刑事辩护、合同纠纷领域），以获取更具体的法律建议和帮助。
综上所述，不能证明标的物来源的合法性，并不直接导致整个合同无效。在处理这类问题时，我们需要综合考虑多个因素，并根据具体情况来判断合同的效力。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。