护理假期间扣除部分绩效工资通常是不合法的，但具体需结合公司规章制度、劳动合同以及相关法律法规综合判断。以下从多个角度为你详细分析：
一、法律法规的明确规定
护理假期间的工资待遇：
- 根据《贵州省人口与计划生育条例》第三十三条（其他地区也有类似规定，如《北京市人口与计划生育条例》、《广东省人口与计划生育条例》等），男方在享受护理假期间，工资应照发，福利待遇不得改变，且护理假不影响考勤、考核以及晋级、晋职和提薪。这表明，护理假期间，职工的工资和绩效都应得到充分保障，不应被扣除。
- 《关于工资总额组成的规定》第四条也明确指出，工资总额包括绩效工资作为其中的一部分，属于职工应得的劳动报酬。因此，护理假期间扣除绩效工资，实际上是在降低职工的工资待遇，这与法律法规的规定相悖。
特殊劳动保护权益：
- 护理假是职工依法享有的权益，旨在保障职工在配偶生育等特定情况下能够履行照顾家庭的责任。在此期间，职工视为出勤，其性质与正常出勤相似。因此，用人单位不应以职工休护理假为由，扣除其绩效工资。
二、公司规章制度与劳动合同的考量
公司规章制度：
- 如果公司规章制度中明确规定护理假期间要扣除绩效工资，并且这些规定不违反法律法规（如扣减依据合理、程序合法等），则扣绩效可能具有某种“合理性”（但需注意，这种“合理性”并不等同于合法性，因为法律法规对护理假期间的工资待遇有明确规定，公司规章制度不能与之相抵触）。
- 然而，在大多数情况下，公司规章制度中关于护理假期间扣除绩效工资的规定，很可能因违反法律法规而无效。因为法律法规的效力高于公司规章制度，当两者发生冲突时，应以法律法规为准。
劳动合同：
- 劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。如果劳动合同中明确规定护理假期间不扣除绩效工资，则用人单位应遵守该约定。
- 如果劳动合同中无此规定，或规定本身不合法（如违反法律法规、显失公平等），则用人单位不能随意扣减员工的绩效工资。
三、实践中的维权途径
沟通协商：
- 如果职工在护理假期间遭遇绩效工资被不合理扣除的情况，首先应与用人单位进行沟通协商，说明法律规定和自身权益，要求用人单位纠正不合理行为。
投诉举报：
- 协商无果后，职工可以向当地劳动监察部门投诉举报。劳动监察部门有权对用人单位的违法行为进行调查和处理，并要求用人单位支付被扣除的绩效工资。
劳动仲裁或诉讼：
- 若问题仍无法解决，职工可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。在仲裁或诉讼过程中，职工应准备好相关证据（如工资条、工作记录、劳动合同、公司规章制度等），以证明自己的主张。
四、特殊情况下的处理
总结：护理假期间扣除部分绩效工资通常是不合法的。职工应了解自己的权益，并在权益受损时依法维权。如果用人单位存在违法行为，职工可以通过沟通协商、投诉举报或劳动仲裁等途径来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。