核心结论：档案退工单丢失且单位不配合调取时，您可通过协商、投诉、申请劳动仲裁或诉讼等途径解决，具体需结合单位性质、证据情况及当地政策综合判断。以下是具体分析：

1. 优先与单位协商，明确责任与义务

• 法律依据：根据《劳动合同法》第五十条，用人单位应在解除或终止劳动合同时出具证明（即退工单），并在15日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。单位拒绝配合可能涉嫌违法。
• 操作建议：
  • 以书面形式（如邮件、微信）向单位人事部门或负责人提出补办退工单的请求，明确引用法律条款，要求其履行法定义务。
  • 若单位以“丢失”为由推诿，可要求其出具书面说明（如盖章的《情况说明》），作为后续维权证据。

2. 向劳动监察部门投诉，借助行政力量

• 适用场景：单位明确拒绝补办或拖延处理，且协商无果。
• 操作步骤：
  1. 携带身份证、劳动合同、离职证明（如有）等材料，向单位所在地的劳动保障监察大队投诉。
  2. 填写《投诉登记表》，说明单位未出具退工单的具体情况及诉求（如要求补办、赔偿损失等）。
  3. 劳动监察部门将介入调查，若查实单位违法，可责令其限期改正，甚至处以罚款（《劳动保障监察条例》第三十条）。

3. 申请劳动仲裁，主张权益

• 适用场景：单位拒不补办退工单，且您因退工单缺失遭受实际损失（如无法领取失业金、新单位无法入职等）。
• 操作步骤：
  1. 向单位所在地的劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请，附上身份证、劳动合同、离职证明、投诉记录（如有）等证据。
  2. 明确仲裁请求：可包括要求单位补办退工单、赔偿因退工单缺失导致的损失（如失业金损失、误工费等）。
  3. 仲裁委员会将组织调解或开庭审理，若单位败诉，需履行裁决结果。

4. 特殊情况处理：单位已注销或无法联系

• 操作建议：
  • 若单位已注销，可向工商部门查询注销信息，联系原单位股东或清算组，要求其出具退工单或相关证明。
  • 若单位失联，可向当地档案管理部门或人才服务中心咨询，部分地区允许劳动者凭身份证直接查询或复制档案中的退工单副本。

5. 预防措施：未来如何避免类似问题

• 离职时主动要求单位出具退工单，并核对信息无误后签字确认。
• 退工单一式两份，单位和劳动者各执一份，务必妥善保管。
• 若单位以“电子版”形式提供，可要求其加盖公章或通过邮件发送，并保存原始记录。

温馨提示：退工单是证明劳动关系终止的重要文件，缺失可能影响社保转移、失业金领取、新单位入职等权益。若单位仍不配合，建议尽快通过法律途径解决，避免延误。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。