结论：持证报销离职时公司扣钱是否合法，需根据具体情况判断，主要看公司扣除的钱款是否属于合法扣除范围以及是否有合法依据。

分析：

1. 合法扣除范围：

   • 根据《工资支付暂行规定》等相关法律法规，用人单位在特定情况下可以扣除劳动者工资，如代扣代缴个人所得税、社会保险费用、法院判决或裁定中要求代扣的抚养费、赡养费等，以及因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的赔偿（但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准）。
   • 如果公司扣除的钱款不属于上述合法扣除范围，那么公司的行为可能构成违法。

2. 持证报销与离职扣钱的关系：

   • 持证报销通常指的是劳动者因工作需要而产生的费用，如差旅费、业务招待费等，这些费用在符合公司规定和报销流程的情况下，应由公司承担。
   • 如果劳动者在离职时，公司以持证报销为由扣除钱款，需要明确这笔钱款是否确实属于劳动者应承担的费用，以及公司是否有合法的扣除依据。例如，如果劳动者在报销过程中存在虚假报销等违规行为，公司有权根据内部规定或相关法律法规进行扣除。但如果没有合法依据，公司则无权扣除。

3. 公司行为的合法性判断：

   • 如果公司扣除的钱款属于合法扣除范围，且有明确的扣除依据（如公司规章制度、劳动合同等），那么公司的行为是合法的。
   • 如果公司扣除的钱款不属于合法扣除范围，或者没有合法的扣除依据，那么公司的行为是违法的。劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。

建议：

• 如果您遇到持证报销离职时公司扣钱的情况，首先应与公司沟通，了解扣除的具体原因和依据。
• 如果认为公司的扣除行为不合法，可以收集相关证据（如报销凭证、公司规章制度、劳动合同等），向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
• 在处理此类纠纷时，建议咨询专业律师（即我本人，陈俊如律师，专注于劳动纠纷等领域），以便更好地维护自己的合法权益。

可能后果：

• 如果公司的扣除行为被认定为违法，可能需要向劳动者支付被扣除的工资及相应的经济补偿。
• 如果劳动者的行为确实存在违规情况（如虚假报销），可能需要承担相应的法律责任。