结论：在工伤赔偿案件仲裁处理中，若单位对工伤认定不服并在检察院抗诉申请中止，仲裁程序是否中止需视具体情况而定，但通常情况下，工伤认定结论的争议不影响仲裁程序对赔偿事宜的继续审理，除非存在法定中止情形。

一、工伤认定与仲裁程序的关系

工伤认定是劳动行政部门依据法律法规对职工因事故伤害或患职业病是否属于工伤或视同工伤给予的定性行为，是劳动者享受工伤保险待遇的前提。而仲裁程序则是解决劳动争议的一种方式，当劳动者与用人单位就工伤赔偿等事宜发生争议时，可以依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。

二、单位对工伤认定不服的法律后果

1. 行政复议或行政诉讼：单位对工伤认定结论不服的，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。这是单位维护自身权益的合法途径，但并不意味着仲裁程序必须因此中止。

2. 抗诉申请与中止仲裁：单位向检察院申请抗诉，并请求中止仲裁程序，这并非法定中止仲裁的情形。仲裁程序的中止通常需要基于法定事由，如当事人死亡、需要等待有关机关对特定事项作出决定等。

三、仲裁程序是否中止的考量因素

1. 法定中止情形：根据《劳动争议调解仲裁法》等相关法律法规，仲裁程序在特定情形下可以中止，如当事人因不可抗拒的事由或者其他正当理由耽误期限的、需要等待有关机关对特定事项作出决定等。但单位对工伤认定不服并申请抗诉，并不直接构成法定中止仲裁的情形。

2. 仲裁庭的裁量权：在缺乏明确法定中止情形的情况下，仲裁庭有权根据案件具体情况，如工伤认定的争议是否对仲裁案件的审理产生实质性影响等，来决定是否中止仲裁程序。然而，通常情况下，工伤认定结论的争议并不足以导致仲裁程序的中止，因为仲裁庭可以基于现有证据和法律规定对赔偿事宜进行审理。

四、实务建议

1. 继续推进仲裁程序：对于劳动者而言，在单位对工伤认定不服并申请抗诉的情况下，可以继续推进仲裁程序，要求仲裁庭对赔偿事宜进行审理。因为工伤认定结论的争议并不直接影响仲裁庭对赔偿事宜的管辖和审理。

2. 关注工伤认定进展：虽然仲裁程序可以继续进行，但劳动者也应关注工伤认定的进展情况。如果工伤认定结论在仲裁程序期间被撤销或变更，劳动者可能需要根据新的认定结论调整仲裁请求或策略。

3. 寻求法律援助：在处理此类复杂劳动争议时，劳动者可以寻求专业律师的法律援助，以便更好地维护自身权益。

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