用人单位不服工伤劳动仲裁，认为自己不是责任主体，是可以向法院起诉的。以下从多个角度为你详细分析：
法律程序角度
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，劳动仲裁是解决劳动争议的一种前置程序，但并非终局裁决。如果用人单位对劳动仲裁结果不服，包括对工伤认定、责任主体等裁决内容有异议，可以在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。这是用人单位维护自身合法权益的一种法律途径。
责任主体认定角度
如果用人单位确实不是责任主体：
- 在工伤案件中，责任主体的认定通常基于劳动关系、工伤事实以及相关法律法规的规定。如果用人单位能够提供充分证据证明自己并非工伤事故的责任主体，比如工伤事故发生在非工作时间、非工作地点，或者与用人单位无直接劳动关系的人员发生工伤等，那么法院在审理过程中会依法进行认定。
- 如果法院最终认定用人单位不是责任主体，那么用人单位将不承担工伤赔偿责任。
如果用人单位是责任主体但拒不承认：
- 如果用人单位实际上是工伤事故的责任主体，但出于各种原因拒不承认，那么法院在审理过程中会依据事实和法律进行裁决。
- 用人单位需要承担举证责任，如果无法提供充分证据证明自己不是责任主体，或者提供的证据不足以推翻劳动仲裁的裁决，那么法院可能会维持或变更仲裁裁决，要求用人单位承担相应的工伤赔偿责任。
实际操作建议
收集证据：
- 用人单位在提起诉讼前，应充分收集与工伤事故相关的证据，包括但不限于劳动合同、工资单、考勤记录、监控视频、证人证言等，以证明自己不是责任主体或减轻自己的责任。
咨询专业律师：
- 工伤案件涉及复杂的法律关系和证据认定，建议用人单位在提起诉讼前咨询专业律师，了解自身权利和义务，以及诉讼的风险和可能的结果。
积极参与诉讼：
- 在诉讼过程中，用人单位应积极参与，按照法院的要求提交证据、参加庭审等，以维护自己的合法权益。
可能面临的法律后果：
- 如果用人单位胜诉，即法院认定用人单位不是责任主体，那么用人单位将不承担工伤赔偿责任。
- 如果用人单位败诉，即法院认定用人单位是责任主体，那么用人单位需要按照法院的裁决承担相应的工伤赔偿责任，包括医疗费、伤残补助金、一次性工伤医疗补助金等。
综上所述，用人单位不服工伤劳动仲裁，认为自己不是责任主体时，是可以向法院起诉的。但起诉前应充分收集证据、咨询专业律师，并积极参与诉讼过程。如果你还有其他关于劳动工伤的问题，可以直接向我咨询。