核心前提：您在某单位连续工作25年但未办理正式用工手续（如未签劳动合同、未缴纳社保等），现因劳动关系问题产生纠纷，需明确赔偿规则。

结论：赔偿需分情况讨论，具体如下：

1. 若单位未签劳动合同但存在事实劳动关系
   根据《劳动合同法》第14条，用人单位自用工之日起满1年不与劳动者订立书面劳动合同的，视为已订立无固定期限劳动合同。您工作25年，虽未签合同，但已形成事实劳动关系，单位需补缴社保、支付未签合同期间的双倍工资差额（但双倍工资最多主张11个月，25年已过时效，无法主张），并可能需支付经济补偿金（若单位违法解除劳动关系）。

2. 若单位未缴纳社保
   根据《社会保险法》第58条、第63条，单位必须为员工缴纳社保。您可要求单位补缴25年社保（需提供工资记录、工作证明等材料），若单位拒绝，可向当地社保部门投诉或申请劳动仲裁。若因未缴社保导致您无法享受养老、医疗等待遇，单位需赔偿损失（如退休金差额、医疗费等）。

3. 若单位违法解除劳动关系
   若单位以“未办手续”为由单方解除劳动关系，可能构成违法解除。根据《劳动合同法》第87条，您可主张赔偿金，标准为经济补偿金的2倍（经济补偿金按工作年限计算，每满1年支付1个月工资，25年即25个月工资，赔偿金为50个月工资）。

4. 若您主动离职或协商解除
   若您因单位未办手续主动离职，可能无法主张赔偿金，但可要求单位补缴社保、支付未休年假工资等。若双方协商解除，可约定补偿金额（需书面协议）。

行动建议：

• 收集证据：工资条、工作证、考勤记录、同事证言等证明劳动关系及工作年限的材料；
  
• 协商优先：与单位沟通补缴社保、签订无固定期限合同或支付补偿；
  
• 申请仲裁：若协商无果，向当地劳动仲裁委申请仲裁（时效为1年，自知道权益受损之日起算）；
  
• 诉讼途径：对仲裁结果不服的，可向法院起诉。
  

提示：劳动关系问题涉及证据收集、时效计算等细节，建议根据具体情况进一步向我咨询，我会结合您的证据和当地政策提供具体方案。