事业单位在年休假期间扣钱是否合法，需分情况讨论：

1. 若员工依法享受年休假且未违反单位规定，单位扣钱不合法

   • 法律依据：根据《职工带薪年休假条例》第二条，机关、团体、企业、事业单位、民办非企业单位、有雇工的个体工商户等单位的职工连续工作1年以上的，享受带薪年休假（以下简称年休假）。单位应当保证职工享受年休假。职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。
   • 法律解释：这意味着，只要员工符合享受年休假的条件，且未违反单位关于年休假的规定（如未提前请假、未按规定时间休假等，但此处的“违反规定”需合理且不违反法律法规），单位就应当支付员工在年休假期间的工资，不得扣减。

2. 若员工因个人原因（非单位原因）未享受年休假，且单位已支付未休假工资报酬，则单位后续处理需谨慎

   • 特殊情况说明：如果员工因个人原因（如个人安排、个人原因请假等）未享受年休假，且单位已经按照《职工带薪年休假条例》第五条的规定，支付了员工未休假工资报酬（即按照员工日工资收入的300%支付年休假工资报酬，其中包含单位支付员工正常工作期间的工资收入），那么单位在后续处理上需谨慎。但通常来说，单位不会因此再扣减员工其他工资或福利，除非员工存在其他违反单位规章制度的行为。
   • 法律风险提示：如果单位在员工未享受年休假且已支付未休假工资报酬的情况下，还无故扣减员工其他工资或福利，这可能构成违法行为，员工有权依法维护自己的合法权益。

3. 若员工违反单位合理规章制度导致无法享受年休假，单位可能有权扣减相关福利（但需谨慎操作）

   • 规章制度合理性：如果单位有合理的规章制度，且该规章制度明确规定了员工在违反某些规定时将无法享受年休假或相关福利，那么单位在员工违反这些规定时，可能有权按照规章制度扣减相关福利。但需要注意的是，这些规章制度必须合法、合理，且已经过民主程序制定并公示或告知员工。
   • 法律操作建议：即使单位有这样的规章制度，也建议单位在操作时谨慎行事，确保扣减的福利与员工违反的规定直接相关，且扣减的幅度合理。否则，单位可能面临法律风险。

总结与建议：

• 一般情况下，事业单位在员工依法享受年休假期间扣钱是不合法的。
• 如果员工因个人原因未享受年休假且单位已支付未休假工资报酬，单位通常不会因此再扣减员工其他工资或福利。
• 如果员工违反单位合理规章制度导致无法享受年休假，单位在操作时需谨慎，确保扣减的福利与员工违反的规定直接相关且幅度合理。
• 若您遇到事业单位在年休假期间扣钱的情况，且认为该行为不合法，建议您先与单位沟通协商；若协商无果，您可以依法向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁以维护自己的合法权益。有问题可以直接向我咨询，我会结合您具体情况详细解答。