审计扣掉规费是否合法，这并非一个简单的“是”或“否”的问题，而是需要依据具体情况和相关法律法规来综合判断。以下是我从不同角度为你进行的分析：

一、审计的权限与目的

审计，作为一种经济监督活动，其核心目的是对企业的财务收支、经济活动等进行审查，以确认其真实性、合法性和效益性。审计机构或审计人员在执行审计任务时，确实有权对发现的问题进行指出，并提出相应的处理建议。然而，这并不意味着审计机构或审计人员有权直接扣减企业的规费或其他费用。

二、规费的性质与支付义务

规费，通常指的是企业按照法律法规规定必须缴纳的费用，如税费、社保费等。这些费用具有强制性，企业必须按时足额缴纳。从法律角度来看，规费的支付义务是法定的，企业不得以任何理由拒绝支付或扣减。

三、审计扣减规费的合法性分析

1. 若审计发现规费计算错误或存在多缴情况：

   • 在这种情况下，审计机构或审计人员可以指出问题，并建议企业向相关部门申请退还多缴的规费。但审计机构或审计人员本身并无权直接扣减或退还规费，这一行为应由企业自行向相关部门申请并办理。

2. 若审计发现企业存在少缴或未缴规费的情况：

   • 审计机构或审计人员应指出问题，并建议企业及时补缴规费，同时可能面临相应的法律责任，如罚款、滞纳金等。但同样，审计机构或审计人员并无权直接扣减企业其他资金来补缴规费。

3. 审计机构或审计人员擅自扣减规费：

   • 如果审计机构或审计人员在未获得企业同意或未依据相关法律法规的情况下，擅自扣减企业的规费，那么这一行为很可能是违法的。企业有权对此提出异议，并寻求法律途径来维护自己的合法权益。

四、法律建议

• 对于企业而言：如果认为审计机构或审计人员的行为存在不当或违法，应及时收集证据，并向相关部门（如审计机关的上级部门、行业协会等）进行投诉或举报。同时，也可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。
• 对于审计机构或审计人员而言：应严格遵守相关法律法规和审计准则，确保审计行为的合法性和合规性。在发现企业存在规费问题时，应依法提出处理建议，但不得擅自扣减或退还规费。

总结来说，审计扣掉规费是否合法，取决于具体情境和法律法规的规定。如果你对此有进一步的疑问或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询。