结论前置：非法营运被抓时，是否需对两年前的违法记录一并罚款，需分情况讨论，具体如下：

1. 若两年前的非法营运行为未被查处，且已过行政处罚追责时效
   根据《行政处罚法》第三十六条，违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚（涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，追责时效延长至五年）。因此，若两年前的非法营运行为未被交通执法部门掌握，且不属于上述延长时效的情形，则无需对两年前的行为罚款，仅对当前查实的违法行为处罚。

2. 若两年前的非法营运行为已被立案或已进入处罚程序，但未执行完毕
   若两年前因非法营运被立案调查，但因故未完成处罚（如当事人逃逸、案件中止等），则行政机关可恢复处罚程序，对两年前的行为一并处罚。此时罚款的依据是原违法事实，而非“重新发现”。

3. 若两年前的非法营运行为与当前行为存在连续或持续状态
   若非法营运行为具有连续性（如长期无证运营），且当前查处时仍存在违法状态，则行政机关可将两年内的行为视为“同一违法行为”的延续，合并处罚。此时罚款范围可能覆盖两年内的违法所得或经营行为。

关键点提示：

• 行政处罚的追责时效以“发现违法行为”为起点，而非“违法行为发生时间”。若两年前的行为已被记录（如监控、举报等），但未及时处理，仍可能被追责。
  
• 实践中，交通执法部门通常会对当前查实的违法行为处罚，若需追溯既往行为，需有明确证据证明违法事实的连续性或未过追责时效。
  

建议：若您涉及此类情况，可整理相关证据（如两年前的运营记录、处罚通知等），向我进一步咨询具体案件的处罚合理性及应对策略。