结论：商铺因违建没有规划许可证，导致租房合同无效的情况下，承租人通常仍需支付房屋占有使用费，但具体金额和支付方式可能需要根据实际情况和双方过错程度来确定。
详细分析：
合同无效的法律后果：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，违反法律、行政法规的强制性规定的合同无效。商铺违建没有规划许可证，显然违反了相关法律法规，因此租房合同无效。
- 合同无效后，因该合同取得的财产，应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失，双方都有过错的，应当各自承担相应的责任。
房屋占有使用费的支付：
- 尽管合同无效，但承租人在实际占有和使用商铺期间，确实享受了商铺带来的利益。因此，从公平原则出发，承租人通常需要支付一定的房屋占有使用费。
- 房屋占有使用费的金额和支付方式，可能需要根据双方的实际损失、过错程度、商铺的实际使用情况等因素来综合确定。如果承租人明知商铺违建仍选择租赁，可能需承担更大的过错责任；如果房东故意隐瞒商铺违建情况，则房东可能需承担更大的过错责任。
特殊情况考虑：
- 如果承租人在租赁期间已经支付了租金，且租金金额合理反映了商铺的实际价值和使用情况，那么在合同无效后，承租人可能无需再额外支付房屋占有使用费。
- 如果房东在合同无效后要求承租人立即搬离商铺，但承租人因合理原因无法立即搬离（如需要寻找新的经营场所、搬迁设备等），那么承租人可能只需支付实际占有和使用商铺期间的房屋占有使用费。
法律建议：
- 协商解决：首先，建议双方尝试通过协商来解决争议。双方可以就房屋占有使用费的金额、支付方式、支付期限等事项进行友好协商，以达成一致意见。
- 法律途径：如果协商无果，双方可以通过法律途径来解决争议。承租人可以向法院提起诉讼，要求确认合同无效并请求法院根据实际情况判决房屋占有使用费的金额和支付方式。
- 保留证据：在处理此类争议时，双方都应保留好相关证据，如租赁合同、租金支付凭证、商铺违建的相关证据等，以便在需要时提供给法院或仲裁机构。
可能后果：
- 如果承租人拒绝支付房屋占有使用费，房东可能会通过法律途径来追讨。这可能导致承租人面临法律诉讼、财产被查封或冻结等风险。
- 如果房东故意隐瞒商铺违建情况并要求承租人支付高额房屋占有使用费，承租人可以通过法律途径来维护自己的合法权益，要求房东承担相应的法律责任。
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