结论：电子协议上有仲裁条款时，一般不能在原告所在地起诉，而是需要依据仲裁条款向约定的仲裁机构申请仲裁。但存在例外情况，如仲裁条款无效或双方达成新的协议等。
分析说明：
仲裁条款的效力：
- 根据《中华人民共和国仲裁法》的相关规定，当事人达成仲裁协议，一方向人民法院起诉的，人民法院不予受理，但仲裁协议无效的除外。这意味着，如果电子协议中明确包含了有效的仲裁条款，那么双方应当通过仲裁方式解决争议，而不是向法院起诉。
仲裁条款无效的情形：
- 仲裁条款并非绝对有效，如果存在以下情形之一，仲裁条款可能被视为无效：约定的仲裁事项超出法律规定的仲裁范围；无民事行为能力人或者限制民事行为能力人订立的仲裁协议；一方采取胁迫手段，迫使对方订立仲裁协议的。在这些情况下，当事人可以向法院起诉。
例外情况：
- 除了仲裁条款无效外，如果双方在争议发生后达成了新的协议，同意通过诉讼方式解决争议，并且该新协议不违反法律、行政法规的强制性规定，那么当事人也可以向法院起诉。
法律建议：
- 审查仲裁条款：在签订电子协议时，务必仔细审查其中的仲裁条款，确保其内容明确、合法有效。如果对仲裁条款有疑问或不确定其效力，建议咨询专业律师。
- 考虑争议解决方式：在签订协议前，双方应充分考虑未来可能出现的争议，并协商确定合适的争议解决方式。如果选择仲裁方式，应明确约定仲裁机构、仲裁规则等事项；如果选择诉讼方式，则应了解相关法院的管辖范围和诉讼程序。
- 及时寻求法律帮助：如果因电子协议中的仲裁条款引发争议，且无法通过协商解决，建议及时寻求专业律师的帮助，以便更好地维护自己的合法权益。
后续行动与可能后果：
- 如果电子协议中的仲裁条款有效，且双方未达成新的协议，那么当事人应当向约定的仲裁机构申请仲裁。如果一方违反仲裁条款向法院起诉，法院可能会裁定不予受理或驳回起诉。
- 如果仲裁条款无效或双方达成新的协议同意诉讼解决，那么当事人可以向有管辖权的法院提起诉讼。在诉讼过程中，双方应遵守诉讼程序，积极举证、质证，以便法院能够公正、及时地审理案件。
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