结论：经人民调解委员会调解达成的协议履行期限已过，若该协议本身仍然有效且符合司法确认的条件，仍然可以申请司法确认。但需注意，若因履行期限已过导致协议内容无法执行或存在其他不符合司法确认条件的情形，则可能无法申请。

详细分析：

1. 司法确认的基本条件：

   • 调解协议需由双方当事人自愿达成，且内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不损害社会公共利益或他人合法权益。
   • 双方当事人需具备完全民事行为能力，且意思表示真实。
   • 调解协议的内容应明确具体，能够确定具体的履行方式。

2. 履行期限已过的影响：

   • 履行期限的经过本身并不直接导致调解协议失效。只要协议内容仍然有效，且符合上述司法确认的基本条件，理论上仍然可以申请司法确认。
   • 但若因履行期限已过，导致协议内容无法执行（如标的物已灭失、对方已丧失履行能力等），则可能因不符合“调解协议内容明确具体，能够确定具体的履行方式”这一条件，而无法申请司法确认。

3. 申请司法确认的流程：

   • 双方当事人需在调解协议生效之日起三十日内（注意，此处的“三十日”是调解协议生效后的期限，与履行期限不同）共同向人民法院申请司法确认。
   • 申请时需提交调解协议、调解组织主持调解的证明等材料。
   • 人民法院在收到申请后，会依法对调解协议进行审查。若确认调解协议合法有效，法院将出具民事裁定书，裁定该调解协议具有法律效力，并因此获得强制执行力。

4. 特殊情况的处理：

   • 若因履行期限已过导致协议内容无法执行，双方当事人可考虑重新协商达成新的调解协议，并就新协议申请司法确认。
   • 若一方当事人拒绝履行或未全部履行已获司法确认的调解协议，对方当事人可直接向法院申请强制执行。

建议：

• 在申请司法确认前，建议双方当事人仔细审查调解协议的内容，确保其仍然有效且符合司法确认的条件。
• 若对调解协议的有效性或司法确认的流程存在疑问，可直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律意见。

法律依据：

• 《中华人民共和国人民调解法》第三十三条：“经人民调解委员会调解达成调解协议后，双方当事人认为有必要的，可以自调解协议生效之日起三十日内共同向人民法院申请司法确认，人民法院应当及时对调解协议进行审查，依法确认调解协议的效力。”