申请工伤时，即使资料齐全，社保部门仍有可能来公司进行调查，但并非一定会来。这主要取决于多种因素，以下从不同角度为你详细分析：

一、社保部门调查的目的与依据

社保部门在受理工伤认定申请后，有权根据需要对用人单位、工伤职工或者其近亲属、医疗机构、工会组织等有关单位和个人进行调查核实。这是为了确保工伤认定的准确性，防止虚假工伤的发生，保护用人单位和工伤职工的合法权益。调查的依据主要是《工伤保险条例》第十九条，该条规定：“社会保险行政部门受理工伤认定申请后，根据审核需要可以对事故伤害进行调查核实，用人单位、职工、工会组织、医疗机构以及有关部门应当予以协助。”

二、可能引发调查的情况

1. 事故情况复杂或存在疑点：如果工伤事故的情况比较复杂，或者存在一些疑点，如事故发生的时间、地点、原因等不明确，或者工伤职工的伤情与事故描述不符等，社保部门可能会进行调查，以核实事故的真实性和工伤的合理性。

2. 用人单位提出异议：如果用人单位对工伤认定申请提出异议，认为不属于工伤或者对工伤事实有争议，社保部门可能会进行调查，以听取用人单位的意见和证据，并作出公正的认定。

3. 需要进一步了解情况：即使资料齐全，但社保部门认为还需要进一步了解事故的具体情况、工伤职工的伤情、治疗情况等，也可能会进行调查。

三、调查的方式与内容

社保部门进行调查时，通常会采取以下方式：

• 实地调查：到事故现场进行勘查，了解事故发生的经过和原因。
• 询问相关人员：询问工伤职工、用人单位负责人、目击者等，了解事故的具体情况和工伤职工的伤情。
• 查阅相关资料：查阅用人单位的安全生产记录、工伤职工的医疗记录等，以核实工伤的真实性和合理性。

四、对用人单位的建议

1. 积极配合调查：如果社保部门来公司进行调查，用人单位应积极配合，提供必要的协助和资料，如实陈述事故发生的经过和原因。

2. 保留相关证据：用人单位应妥善保留与工伤事故相关的证据，如安全生产记录、监控录像、医疗记录等，以备社保部门调查时使用。

3. 及时沟通与反馈：如果用人单位对工伤认定有异议或者认为社保部门的调查存在不当之处，应及时与社保部门进行沟通与反馈，维护自身的合法权益。

总结来说，申请工伤时资料齐全并不意味着社保部门一定不会来公司调查。是否进行调查取决于多种因素，包括事故情况的复杂性、用人单位的异议以及社保部门对进一步了解情况的需求等。因此，用人单位应做好应对调查的准备，积极配合社保部门的工作，以确保工伤认定的顺利进行。如果你在工伤认定过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。