新入职的员工如果碰上集体合同无效的情况，首先不要过于担心，因为我国法律对于此类问题有明确的处理流程和规定。以下是一些详细的建议，希望能帮助你更好地理解和应对这一问题：

一、了解集体合同无效的原因

集体合同无效可能由于多种原因造成，比如合同内容违反法律法规、签订程序不合法等。了解无效的具体原因，有助于你更准确地判断后续的处理方式。

二、与用人单位协商

一旦发现集体合同无效，你可以首先尝试与用人单位进行协商，看是否能够通过协商达成一个双方都能接受的解决方案。协商是解决争议的一种较为温和且高效的方式。

三、寻求劳动行政部门的帮助

如果协商不成，你可以向当地人民政府劳动行政部门反映情况。根据《中华人民共和国劳动法》的规定，因签订集体合同发生争议，当事人协商解决不成的，当地人民政府劳动行政部门可以组织有关各方协调处理。劳动行政部门会依法进行调查，并给出相应的处理意见。

四、申请劳动争议仲裁

如果因履行集体合同发生争议，且协商解决不成，你可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。仲裁委员会会依法进行裁决，裁决结果具有法律效力。你需要按照《中华人民共和国劳动法》的规定，在劳动争议发生之日起六十日内向劳动争议仲裁委员会提出书面申请。

五、提起诉讼

如果你对仲裁裁决不服，可以自收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。法院会依法进行审理，并作出最终判决。这是解决劳动争议的最后一道法律程序。

六、关注个人权益保护

在整个处理过程中，你要时刻关注自己的个人权益是否受到侵害。如果用人单位因集体合同无效而侵犯了你的劳动权益，你可以依法要求用人单位承担责任。同时，你也可以向工会寻求帮助，工会会依法维护你的合法权益。

七、了解相关法律法规

为了更好地应对此类问题，建议你深入了解《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规。这些法律法规为你提供了明确的权益保障和维权途径。

总之，新入职的员工碰上集体合同无效的情况时，不要慌张，要依法依规进行处理。通过与用人单位协商、寻求劳动行政部门的帮助、申请劳动争议仲裁或提起诉讼等方式，你可以有效地维护自己的合法权益。同时，也要关注个人权益保护，了解相关法律法规，以便更好地应对未来可能出现的类似问题。