结论前置：若公司存在超时加班且未依法支付加班费或损害员工健康等违法行为，导致员工因此离职，员工有权要求公司支付加班费、经济补偿金，并可能包括赔偿金及补缴社保和公积金。
一、公司违法行为的判断
超时加班未支付加班费：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十一条，用人单位因特殊原因需延长工作时间，每日不得超过3小时，每月不得超过36小时。若公司安排员工超时加班且未依法支付加班费，则构成违法。
- 加班费支付标准依据《劳动法》第四十四条，即延时加班支付不低于工资的150%，休息日加班且不能补休支付不低于工资的200%，法定休假日加班支付不低于工资的300%。
强制加班损害健康：
- 公司强制劳动者超时加班，严重损害其身体健康，或通过超时加班变相逼迫劳动者辞职，均属于违法情形。
二、离职补偿的权益
加班费支付：
- 员工离职时，有权要求公司按照上述标准支付未付的加班费。员工应收集考勤记录、加班通知、工资条等证据以证明加班事实。
经济补偿金：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条和四十六条，若公司存在超时加班等违法行为导致员工离职，员工可要求公司支付经济补偿金。
- 经济补偿金按员工在公司工作的年限计算，每满一年支付一个月工资，六个月以上不满一年按一年计算，不满六个月支付半个月工资。月工资指劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。具体计算公式为：经济补偿金 = 工作年限 × 月工资（工作年限中不足一年的部分，按实际比例计算，如六个月以上不满一年按一年计算，不满六个月支付半个月工资）。
补缴社保和公积金：
- 若公司在员工在职期间欠缴社保或公积金，员工离职时可要求公司补缴。员工可向劳动监察部门或住房公积金管理中心投诉，由相关部门责令公司限期补缴。
赔偿金（特定情形下）：
- 如果公司在员工提出离职后，以不合理的理由辞退员工或采取其他违法手段解除劳动合同，员工可以要求公司支付赔偿金。赔偿金标准为经济补偿金的二倍。
三、维权途径
收集证据：
- 劳动者应保留所有与加班、工资支付、社保缴纳等相关的证据，如考勤记录、加班申请单、工作记录、工资条、社保缴费记录等。
协商与投诉：
- 首先尝试与公司协商解决，要求支付加班费、经济补偿金等。若协商不成，可向当地劳动行政部门或住房公积金管理中心投诉举报。
劳动仲裁与诉讼：
- 若投诉无果，劳动者可直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司支付相关费用。对仲裁结果不服的，还可向法院提起诉讼，通过法律途径维护自身权益。
综上所述，公司超时加班导致员工离职的补偿问题涉及多个方面，包括加班费、经济补偿金、社保和公积金补缴以及特定情形下的赔偿金。劳动者在维权过程中应充分收集证据，并依法通过协商、投诉、劳动仲裁或诉讼等途径来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。