结论前置：公司承包建筑工程中，农民工受工伤后公司垫付部分医药费就不再垫付的行为，主要违反了《工伤保险条例》以及《安全生产法》的相关规定。
详细分析：
从《工伤保险条例》的角度分析：
- 法律依据：根据《工伤保险条例》第四条：“用人单位应当将参加工伤保险的有关情况在本单位内公示。用人单位和职工应当遵守有关安全生产和职业病防治的法律法规，执行安全卫生规程和标准，预防工伤事故发生，避免和减少职业病危害。职工发生工伤时，用人单位应当采取措施使工伤职工得到及时救治。”
- 法律解读：该条款明确规定了用人单位在职工发生工伤时的救治义务。这意味着，一旦农民工在建筑工程中发生工伤，公司有责任确保其得到及时且必要的医疗救治，包括垫付医药费等。公司仅垫付部分医药费后就不再垫付，显然未履行其应尽的救治义务。
从《安全生产法》的角度分析：
- 法律依据：根据《中华人民共和国安全生产法》第五十六条：“生产经营单位发生生产安全事故后，应当及时采取措施救治有关人员。”以及第五十七条：“从业人员在作业过程中，应当严格落实岗位安全责任，遵守本单位的安全生产规章制度和操作规程，服从管理，正确佩戴和使用劳动防护用品。生产经营单位发生生产安全事故时，单位的主要负责人应当立即组织抢救，并不得在事故调查处理期间擅离职守。”
- 法律解读：这些条款强调了生产经营单位在发生生产安全事故后的救治责任，特别是单位主要负责人的组织抢救义务。在建筑工程中，如果农民工因工作原因受伤，公司作为生产经营单位，有责任立即组织抢救，并确保受伤农民工得到及时救治，包括支付必要的医疗费用。公司停止垫付医药费，可能构成对这一义务的违反。
法律后果与建议：
- 法律后果：如果公司违反上述法律规定，不履行救治义务或停止垫付医药费，可能面临行政处罚，如罚款、责令改正等。同时，受伤农民工或其家属也有权通过法律途径追究公司的责任，要求公司承担医疗费用、赔偿损失等。
- 建议：对于公司而言，应严格遵守相关法律法规，确保在农民工发生工伤时及时履行救治义务，包括垫付医药费等。如果公司确实存在经济困难或无法继续垫付的情况，应及时与受伤农民工或其家属沟通，并寻求政府相关部门或社会救助机构的帮助，以避免法律纠纷和不良社会影响。
进一步思考：
- 在实际操作中，公司应建立健全的工伤保险制度和应急预案，确保在发生工伤事故时能够迅速、有效地进行救治和赔偿。同时，公司也应加强对农民工的安全教育和培训，提高他们的安全意识和自我保护能力，减少工伤事故的发生。
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