结论前置：商户在消费者未收到发票且存在尾款未付的情况下直接起诉违约付款，是否合理需分情况讨论，具体如下：

1. 合同约定优先原则
   若双方签订的书面合同中明确约定”消费者需在收到发票后X日内支付尾款”，则商户在未履行发票交付义务前直接起诉违约付款，缺乏合同依据。根据《民法典》第526条，商户作为先履行义务方（交付发票），在未完成义务时无权要求消费者履行后义务（支付尾款），此时起诉可能被法院驳回或要求商户先履行发票交付义务。

2. 合同未约定发票交付与付款顺序时
   若合同未明确约定发票交付与付款的先后顺序，根据《民法典》第510条，应按照交易习惯或行业惯例处理。若行业惯例为”付款后开具发票”，则消费者未支付尾款构成违约，商户起诉具有合理性；若惯例为”先票后款”或无明确惯例，则商户需举证证明消费者存在恶意拒付行为，否则可能承担举证不能的不利后果。

3. 商户已实际交付发票但消费者否认时
   若商户能通过物流记录、签收凭证等证据证明发票已送达消费者，而消费者仍以”未收到发票”为由拒付尾款，商户起诉违约付款具有充分合理性。此时消费者可能构成《民法典》第577条规定的”不履行合同义务”，需承担继续履行、赔偿损失等违约责任。

4. 消费者已部分付款且商户未提出异议时
   若消费者已支付大部分款项，仅剩少量尾款未付，且商户此前未对付款方式提出异议，此时商户突然以”未收到发票”为由起诉违约，可能被法院认定为”权利滥用”。根据《民法典》第6条，民事主体从事民事活动应遵循公平原则，商户需证明其未收到发票与消费者拒付尾款存在直接因果关系。

实务建议：

• 对消费者而言：若未收到发票，应立即书面催告商户交付，并保留催告记录；若商户拒绝交付，可主张同时履行抗辩权（暂停支付尾款直至收到发票）。
  
• 对商户而言：建议先通过律师函催告消费者付款，同时补充交付发票；若消费者仍拒付，再起诉时需同步提交发票交付证据（如EMS签收单、电子发票发送记录等）。
  

如需进一步分析具体合同条款或证据材料，可直接向我提供详细信息，我将结合《发票管理办法》及司法实践为您制定应对方案。