发现单位分多次发放工资时，您可按以下步骤处理，核心结论为：先核实合法性，再根据情况采取相应措施：

1. 核实分次发放的合法性
   根据《工资支付暂行规定》第七条，工资至少每月支付一次，但未禁止分次发放。若单位与您签订的劳动合同、集体合同或规章制度中明确约定了分次发放方式（如每月分两次发放基本工资和绩效），且发放总额不低于当地最低工资标准、不拖欠工资，则属于合法操作。
   例如：若合同约定“每月5日发放基本工资，20日发放绩效”，且两次发放总额与应发工资一致，则无需干预。

2. 若分次发放存在违法情形，可采取以下措施

   • 情形1：未约定分次发放，且影响权益
     若单位未与您协商一致，擅自分次发放且导致您无法及时使用工资（如影响贷款还款、社保缴纳等），或分次发放后存在拖欠（如第二次发放延迟超过合理期限），则涉嫌违法。
     应对方式：

     1. 与单位协商，要求按约定时间一次性发放或明确分次发放规则；
        
     2. 若协商无果，可向当地劳动监察大队投诉（需提供劳动合同、工资条、银行流水等证据）；
        
     3. 若因拖欠工资导致损失（如逾期利息、违约金），可要求单位赔偿。

   • 情形2：分次发放涉嫌偷逃税费或社保
     若单位通过分次发放将部分工资拆分为“报销款”“补贴”等非工资项目，以减少社保缴费基数或个人所得税，则涉嫌违法。
     应对方式：

     1. 保留工资条、银行流水、单位内部通知等证据；
        
     2. 向税务部门举报（通过12366纳税服务热线或当地税务局官网）；
        
     3. 若因此导致社保权益受损（如养老金减少），可要求单位补缴或向社保部门投诉。

3. 特殊情况：分次发放的合理性边界
   若单位因经营困难临时分次发放（如先发基本生活费，后续补发剩余工资），需满足以下条件才合法：

   • 与工会或职工代表协商一致；
     
   • 发放金额不低于当地最低工资标准；
     
   • 明确补发时间并书面告知员工。
     若单位未满足上述条件，您有权拒绝并要求按原方式发放。

温馨提示：处理此类问题时，建议优先通过书面形式（邮件、微信等）与单位沟通，保留证据。若涉及金额较大或权益受损严重，可直接向我咨询具体操作方案。