备案专用章盖合同是否有效，需根据具体情况判断，但通常情况下，备案专用章若作为合同专用章使用且符合相关条件，合同是有效的。以下从不同角度进行分析：

备案专用章作为合同专用章使用的有效性

1. 符合企业使用规范：

   • 若企业依法刻制并备案了备案专用章，且该章被明确用于签订合同，同时企业在日常经营中实际使用该章签订合同，且合同其他方面均符合法律规定，则该合同有效。例如，某公司依法刻制并备案了备案专用章，并明确该章用于合同签订，在与另一公司签订合同时加盖此章，且合同内容合法，则该合同有效。

2. 在授权范围内使用：

   • 企业内部应建立明确的印章使用授权制度。若备案专用章被授权用于签订合同，且员工在获得相应授权后，在授权的业务范围和权限内使用该章签订合同，则合同有效。如某企业销售部门员工获授权使用备案专用章签订销售合同，只要该业务在其授权范围内，所签合同即具法律效力。

备案专用章盖合同可能无效的情形

1. 备案专用章非合同专用章且未获授权：

   • 若备案专用章并非企业专门用于签订合同的印章，且未获得企业授权用于合同签订，则使用该章签订的合同可能因印章使用不当而无效。例如，企业备案的财务专用章被擅自用于签订合同，且未获企业授权，则该合同可能无效。

2. 合同内容违法或违背公序良俗：

   • 即使合同上加盖了备案专用章，但如果合同内容违反法律、行政法规的强制性规定，或违背公序良俗，该合同将被认定为无效。例如，涉及非法交易的合同，无论是否盖章，均因违法而无效。

3. 超越授权范围且相对人非善意：

   • 若员工超越企业对其使用备案专用章的授权范围签订合同，且合同相对人知晓或应当知晓该超越授权的情况，则合同专用章的使用无效。例如，企业仅授权员工签订金额100万元以下的合同，但该员工未经允许签订了200万元的合同，且相对方知悉此情况，则此合同可能被认定无效。

实践建议

为确保合同的合法性和有效性，建议在签订合同时采取以下措施：

• 确认印章性质与授权：在签订合同前，务必确认对方使用的印章是否为企业专门用于签订合同的印章，并确认签约人是否获得相应授权。
• 审查合同内容：仔细审查合同内容，确保其不违反法律法规的强制性规定，也不违背公序良俗。
• 保留证据：在合同签订过程中，保留好相关证据，如合同文本、签约过程记录等，以备后续可能出现的纠纷解决之需。

综上所述，备案专用章盖合同是否有效，需根据印章性质、授权范围、合同内容等多方面因素综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。