合同专用章在符合法定和约定条件时具有法律效力，但具体是否有效需根据实际情况判断。以下是对合同专用章效力的详细分析：
一、合同专用章有效的情形
符合法律规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这里的“盖章”明确包含合同专用章。只要合同专用章真实且使用符合规定，其效力与公章等同，能够证明合同主体的真实意思表示。
- 举例：甲公司依法刻制并备案了合同专用章，在与乙公司签订合同时加盖此章，且合同其他方面均符合法律规定，则该合同有效。
在授权范围内使用：
- 企业内部应建立明确的合同专用章使用授权制度。员工在获得相应授权后，需在授权的业务范围和权限内使用合同专用章。
- 举例：某企业销售部门员工获授权使用合同专用章签订销售合同，只要该业务在其授权范围内，所签合同即具法律效力。
交易习惯认可：
- 在长期商业往来中，若交易双方已形成使用特定合同专用章的习惯，即使该印章存在形式瑕疵，但双方均认可其效力，则合同仍可能被认定有效。
- 举例：A、B两企业长期合作，一直使用A企业未备案但长期使用的合同专用章，基于双方的交易习惯，法院可能认定该印章的使用有效。
二、合同专用章无效或存在争议的情形
印章系伪造、私刻：
- 如果合同上加盖的合同专用章是伪造或未经授权私刻的，且相对人对此知情或者应当知情，那么该合同可能不具有法律效力。
- 举例：丙伪造丁公司的合同专用章与戊公司签订合同，戊公司不知情但印章明显不符或未核实授权文件，可能构成恶意串通或重大过失，导致合同无效或部分无效。
超越权限使用：
- 盖章人超越了其权限范围使用合同专用章，而相对人知道或者应当知道盖章人无此权限的，合同可能无效。
- 举例：公司规定某部门合同专用章的使用限额，而该部门却超出限额使用，且对方知晓此情况，此时合同的效力可能会受到影响。
违反法律法规强制性规定：
- 即使合同上加盖了有效的合同专用章，但如果合同内容违反了法律、行政法规的强制性规定，合同依然可能被认定为无效。
- 举例：甲乙双方使用合同专用章签订买卖毒品的合同，因违反法律强制性规定，该合同无效。
三、使用合同专用章的注意事项
- 确保印章真实且合规刻制：合同专用章需按照法定程序刻制，并在相关部门备案。避免使用伪造或私刻的印章。
- 确认盖章人具有相应授权：盖章前应确认盖章人具有相应的授权，且在权限范围内使用印章。
- 审查合同内容合法性：合同内容应遵守法律法规的强制性规定，确保合同的合法性和有效性。
四、争议解决建议
- 司法鉴定：如发生纠纷，可通过专业机构鉴定印章真伪及形成时间。
- 举证责任分配：主张合同有效的一方需提供印章备案证明、授权文件等证据；质疑方需证明印章虚假或存在重大瑕疵。
- 法律救济途径：可向法院起诉要求确认合同效力，或向公安机关报案追究伪造印章的刑事责任。
总结：合同专用章在合同签订中具有法律效力，但其有效性受多个因素影响。在使用合同专用章时，应谨慎行事，确保一切合规合法，以避免潜在的法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。