在解答您关于“发票专用章盖合同是否有效”的问题时，我们可以明确地说，在合同签订过程中，使用发票专用章通常是无效的。为了确保合同的合法性、有效性和双方真实意愿的表达，我们应当使用合同专用章或公章进行盖章。

发票专用章的用途与限制

发票专用章是专为开具发票而设计的印章，它的主要作用是确认发票的真实性和合法性，表明发票的开具主体及有效性。这种印章的用途被明确限定在发票相关事项上，不可用于其他法律文件，如合同。

合同印章的正确使用

合同是确立合同双方权利义务关系的重要法律文件，其签订和履行需遵循严格的法律程序和规定。在合同签订过程中，加盖合同专用章或公章是确认合同法律效力的关键步骤。这些印章代表了公司的法人意志和授权，具有明确的法律意义。公章代表着公司的整体意志，具有最高的法律效力；而合同专用章则是专门为签订合同而刻制的印章，使用该章签订合同表明公司对合同内容的认可和承担相应法律责任。

加盖发票专用章的风险

如果在合同上错误地加盖了发票专用章，这可能会导致合同无效或被认定为未成立。因为发票专用章并不具备确认合同法律效力的功能，它无法代表公司对合同内容的认可和承担法律责任的意愿。此类合同可能无法受到法律的保护，从而在后续涉及合同效力、履行等法律纠纷时，面临合同效力不被认可等风险。

特殊情况与建议

尽管发票专用章一般不能用于合同签署，但在某些特殊情况下，如双方当事人都已经按照合同的约定实际履行了主要义务，并且双方对此均无异议，或者另一方当事人对盖有发票章的合同明确表示认可，合同仍可能被认定有效。然而，这种情况并不常见，且存在法律风险。

为了避免因使用不当印章而导致的法律风险，我们建议您在签订合同时务必使用正确的印章，即合同专用章或公章。同时，要加强印章的管理和保管，防止被滥用或盗用。如果在合同签订过程中不小心加盖了发票章，应立即与对方协商，重新加盖公章或合同专用章，以确保合同的法律效力。

综上所述，为了保障合同的合法性和有效性，双方当事人在签订合同时应严格遵守相关法律法规和商业习惯，使用正确的印章进行盖章。