关于员工不能亲自来办理离职手续，是否可以通过微信确认的问题，这涉及到劳动合同解除的法定形式和程序，以及意思表示的真实性与合法性。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条的规定，劳动者提前30日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。这里的“书面形式”，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，不仅包括传统的纸质文件，还包括能够有形地表现所载内容，并可以随时调取查用的数据电文，如电子邮件、即时通信信息等。因此，微信信息，作为即时通信应用服务保存的通信信息，也被视为书面形式的一种。
然而，仅仅通过微信确认离职，并不意味着这一行为在所有情况下都是有效和合法的。关键在于：
意思表示的真实性：员工通过微信提出的离职申请，必须是其真实意愿的表达。如果员工是在受到胁迫、欺诈或误解的情况下发出的，那么这一行为可能无效。
公司的确认与接受：公司收到员工的微信离职申请后，应当进行确认，并明确表示接受。如果公司没有明确表示接受，或者员工在发出申请后反悔，而公司又未能及时采取措施防止误解或纠纷的发生，那么可能会引发争议。
离职手续的办理：即使员工通过微信提出了离职申请，并且公司也接受了，员工仍然需要按照公司的规定和流程办理离职手续。这包括但不限于填写离职申请表、交接工作、归还公司财物等。如果员工不能亲自来办理，应当与公司协商并达成一致，可能需要通过其他方式（如邮寄、委托他人代办等）来完成离职手续。
特殊情况的考虑：如果员工因特殊原因（如疾病、意外等）无法亲自来办理离职手续，并且无法通过微信或其他电子方式进行有效沟通，那么公司应当根据实际情况，采取灵活的方式处理员工的离职问题，如延期办理、委托他人代办等。
针对您提出的问题，如果员工不能亲自来办理离职手续，并且希望通过微信进行确认，那么员工应当确保：
如果公司同意员工通过微信确认离职，并且员工也按照公司的要求完成了离职手续的办理，那么这一行为在法律上是有效的。但为了避免可能的纠纷和误解，建议员工和公司在处理离职问题时，尽量采用书面形式（如纸质文件或电子邮件）进行确认和沟通，并保留好相关证据。