结论：厂里以个人所得税理由来签劳动合同这一行为本身不合法，劳动合同的签订应基于劳动关系相关要素，而非个人所得税因素。以下从不同角度进行分析：

从劳动合同签订的法定要素角度

根据《中华人民共和国劳动合同法》规定，劳动合同应当具备以下条款：用人单位的名称、住所和法定代表人或者主要负责人；劳动者的姓名、住址和居民身份证或者其他有效身份证件号码；劳动合同期限；工作内容和工作地点；工作时间和休息休假；劳动报酬；社会保险；劳动保护、劳动条件和职业危害防护等。这些条款主要围绕劳动关系的核心要素，旨在明确双方在劳动关系中的权利和义务。而个人所得税是劳动者取得收入后按照法律规定向国家缴纳的税款，它并非劳动合同签订所应依据的核心要素。厂里以个人所得税理由来签劳动合同，没有将重点放在上述法定必备条款上，不符合劳动合同签订的法定要求，所以这种行为不合法。

从保护劳动者权益角度

劳动合同是保障劳动者权益的重要法律文件。如果厂里以个人所得税理由来签订劳动合同，可能会忽视对劳动者其他重要权益的保障。例如，可能不会明确约定合理的工作内容、工作时间、劳动报酬等关键内容，导致劳动者在后续工作中面临权益受损的风险。比如，劳动者可能不清楚自己的具体工作职责，或者劳动报酬的计算方式不明确，容易引发劳动纠纷。而且这种不合理的签订理由可能会掩盖厂里其他不合理的用工行为，不利于劳动者维护自身的合法权益，因此这种签订方式是不合法的。

从税务与劳动关系的区分角度

个人所得税的缴纳是基于劳动者取得收入这一事实，由税务机关进行征收管理，与劳动合同的签订是两个不同的法律范畴。劳动合同的签订主要规范的是用人单位和劳动者之间的劳动关系，而个人所得税的缴纳是在劳动关系建立后，劳动者取得收入时产生的纳税义务。厂里将个人所得税作为签订劳动合同的理由，混淆了这两个不同的法律关系，没有正确履行签订劳动合同的法定职责，所以这种行为不合法。

如果劳动者遇到厂里以个人所得税理由来签劳动合同的情况，可以向劳动监察部门投诉，以维护自己的合法权益。若还有其他疑问，可直接向我咨询。