核心结论：工程项目私自在农户地里动工，农户可向多个部门反映处理，具体如下：

1. 向当地自然资源主管部门反映
   • 依据：根据《土地管理法》等相关法律法规，我国对土地实行用途管制制度，任何单位和个人进行建设需要使用土地的，必须依法申请使用国有土地；但是，兴办乡镇企业和村民建设住宅经依法批准使用本集体经济组织农民集体所有的土地的，或者乡（镇）村公共设施和公益事业建设经依法批准使用农民集体所有的土地的除外。工程项目私自在农户地里动工，很可能涉及非法占用土地的违法行为。而自然资源主管部门负责土地资源的管理和监督工作，对于非法占地等违法行为有查处职责。
   • 处理方式：农户可以向当地县级以上人民政府自然资源主管部门举报，自然资源主管部门接到举报后，会进行调查核实。如果确认存在非法占地行为，会依法责令停止违法行为，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状，还可以并处罚款；对非法占用土地单位的直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予处分；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
2. 向农业农村主管部门反映（若涉及农村集体土地承包经营相关问题）
   • 依据：如果该工程项目占用的土地是农户承包经营的土地，且涉及农村集体土地承包经营方面的权益受损，农业农村主管部门在农村土地承包经营管理和监督方面有一定的职责。例如，可能存在发包方未经农户同意擅自将土地用于工程项目建设等违反农村土地承包法规定的行为。
   • 处理方式：农户可以向当地农业农村主管部门反映情况，农业农村主管部门会依据农村土地承包相关法律法规进行调查处理，维护农户的承包经营权益，如责令发包方改正违法行为，恢复土地原状或者采取其他补救措施等。
3. 向乡镇人民政府反映
   • 依据：乡镇人民政府在本行政区域内有一定的综合管理职责，对于辖区内的土地使用情况也有一定的监督和管理义务。而且一些小型的工程项目可能是在乡镇范围内实施，乡镇人民政府能够更及时地了解情况并进行协调处理。
   • 处理方式：农户可以向工程项目所在地的乡镇人民政府反映，乡镇人民政府可以组织相关部门进行调查，协调解决纠纷，对于一些轻微的违法行为或者可以通过协调解决的问题，能够起到快速处理的作用。如果问题较为严重，乡镇人民政府也会将情况上报给上级相关部门进一步处理。

如果农户在处理此类问题过程中遇到困难或者有进一步的法律疑问，可以直接向我咨询，我会为你提供详细、专业的解答。