公司以员工迟到多次为由降低薪资，这一做法通常是不合法的。以下从不同角度为你详细分析：
法律背景与规定
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者应当按照劳动合同的约定，全面履行各自的义务。劳动合同一旦签订，即具有法律约束力，双方均应严格遵守。其中，工资作为劳动合同的重要组成部分，其数额和支付方式都应在合同中明确约定。除非双方协商一致，或者出现法定情形（如劳动者不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作的），否则用人单位不得单方面变更劳动合同内容，包括降低薪资。
公司行为的合法性分析
单方面降薪的违法性：公司以员工迟到多次为由降低薪资，属于单方面变更劳动合同内容的行为。除非这种迟到行为严重违反了公司的规章制度，且该规章制度已经过民主程序制定并公示，同时迟到与降薪之间存在直接的因果关系（这在实践中很难证明），否则公司的这种做法是不合法的。
规章制度的合法性要求：即使公司有规章制度规定迟到可以降薪，该规章制度也必须满足以下条件才具有法律效力：一是内容合法，不违反法律法规的强制性规定；二是经过民主程序制定，即经过职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定；三是已经公示或者告知劳动者。如果规章制度不满足这些条件，那么公司依据该规章制度降薪也是不合法的。
法律建议与后果
员工应对措施：如果你作为员工遇到了公司以迟到多次为由降低薪资的情况，首先应当查看自己的劳动合同和公司的规章制度，确认公司降薪的行为是否合法。如果认为公司的行为不合法，你可以与公司进行协商，要求恢复原薪资；如果协商不成，你可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
公司可能面临的法律后果：如果公司单方面降薪的行为被认定为违法，那么公司可能需要承担补发工资、支付经济补偿金等法律责任。同时，这种行为还可能影响公司的声誉和员工的工作积极性，对公司的长期发展不利。
总结来说，公司以员工迟到多次为由降低薪资的做法通常是不合法的。如果你遇到了这种情况，建议先与公司协商，协商不成可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。如果你还有其他关于劳动工伤（工资福利）方面的问题，可以直接向我咨询。