结论前置：从法律风险防范和明确财产归属的角度，建议父亲写首付赠与协议书。以下从不同角度进行分析：

从明确财产归属角度

1. 有赠与协议书的情况：如果父亲写了首付赠与协议书，在协议书中明确表明将首付资金赠与儿子个人所有，那么这笔首付就属于儿子的个人财产。在后续儿子结婚等情况下，根据《中华人民共和国民法典》相关规定，这笔财产一般不会被认定为夫妻共同财产（除非有特别约定），这样能清晰界定财产的归属，避免日后可能出现的财产纠纷。例如，儿子婚后若发生离婚等情况，这笔首付对应的房产增值部分等，在有明确赠与协议表明赠与儿子个人的前提下，儿子配偶一般无权分割。
2. 没有赠与协议书的情况：若没有赠与协议书，当儿子结婚后，在婚姻关系存续期间，虽然房主是儿子，但首付资金在法律上可能会被推定为父亲对儿子和儿子配偶的共同赠与。根据《民法典》婚姻家庭编司法解释，当事人结婚后，父母为双方购置房屋出资的，依照约定处理；没有约定或者约定不明确的，按照民法典第一千零六十二条第一款第四项规定的原则处理，即该出资原则上认定为对夫妻双方的赠与。这样一来，日后若儿子婚姻出现问题，在财产分割时可能会涉及这部分首付资金及其对应的房产权益，引发不必要的纠纷。

从法律风险防范角度

1. 有赠与协议书的情况：签订赠与协议书可以对赠与的条件、方式、撤销情形等进行详细约定。比如，可以约定如果儿子出现某些严重违反公序良俗或者不孝顺等行为，父亲有权撤销赠与。这样能在一定程度上约束儿子的行为，保障父亲的权益，同时也为可能出现的纠纷提供了明确的解决依据。
2. 没有赠与协议书的情况：没有书面协议，一旦发生纠纷，双方各执一词，很难有确凿的证据来证明各自的主张。例如，父亲可能认为首付是借款给儿子，而儿子认为是赠与，在没有书面协议的情况下，举证会非常困难，增加了法律风险和诉讼成本。

从家庭关系维护角度

1. 有赠与协议书的情况：虽然签订赠与协议书看起来有些“生分”，但从长远来看，明确的规定可以避免日后因为财产问题产生矛盾和猜疑，反而有利于家庭关系的稳定。家庭成员之间清楚各自的财产权益，减少了因为财产不明而引发的争吵和纠纷，能让家庭关系更加和谐。
2. 没有赠与协议书的情况：如果没有协议书，一旦家庭关系发生变化，比如儿子婚姻出现问题或者父子之间产生矛盾，就容易因为首付资金的性质和归属问题产生激烈的争执，破坏家庭关系。

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