结论前置：用个体工商户收工资这一行为，其合法性并非绝对，而是取决于具体情境和操作方式。若个体工商户与员工之间存在真实的劳动关系，且工资发放符合相关法律法规要求，则通常是合法的；但若存在利用个体工商户进行违法操作，如逃避税收、社保缴纳等，则是不合法的。
一、合法情况分析
真实劳动关系与合规操作：
- 如果个体工商户与员工之间建立了真实的劳动关系，并签订了书面劳动合同（即使未强制备案，也建议留存），明确工资标准、支付方式等条款，且工资发放符合当地最低工资标准、支付周期与时效等要求，那么通过个体工商户收工资是合法的。
- 例如，某个体工商户经营一家小餐馆，雇佣了数名员工，并按照劳动合同约定，每月通过银行转账或现金方式（需员工签字确认）向员工支付工资，且工资不低于当地最低工资标准，这种情况下，用个体工商户收工资是合法的。
社保缴纳与税务合规：
- 根据《社会保险法》，有雇工的个体工商户需为员工缴纳社保（养老、医疗、失业、工伤、生育保险）。如果个体工商户依法为员工缴纳了社保，并代扣代缴了个人所得税，那么工资发放行为也是合法的。
- 例如，某个体工商户在发放工资时，会从员工工资中扣除社保个人部分和个人所得税，并按时向社保部门和税务机关申报缴纳，这种情况下，用个体工商户收工资同样合法。
二、违法情况分析
逃避税收与社保缴纳：
- 如果个体工商户通过不规范的工资发放方式，如故意混淆收入性质、隐匿真实收入等，以逃避个人所得税和社保缴纳义务，那么这种行为是违法的。
- 例如，某个体工商户为了降低经营成本，未给员工缴纳社保，且通过现金方式发放工资，不留下任何书面记录，以逃避税务核查，这种情况下，用个体工商户收工资就是违法的。
利用个体工商户进行欺诈或虚开发票：
- 如果个体工商户没有真实业务，却通过开具虚假发票套取资金用于发放工资，或者利用个体工商户名义进行其他欺诈行为，那么这种行为也是违法的。
- 例如，某个体工商户为了套取资金，虚构了与某公司的业务往来，并开具了虚假发票，然后将套取的资金用于发放工资，这种情况下，用个体工商户收工资同样违法。
三、对员工的潜在影响
- 如果个体工商户存在违法操作，如逃避税收、社保缴纳等，那么员工可能会因此受到牵连。例如，员工可能无法享受应有的社保待遇，或者在劳动纠纷中因证据不足而难以维护自己的合法权益。
- 此外，如果个体工商户因违法操作而被税务机关或劳动部门查处，那么员工也可能面临工资无法按时发放、工作不稳定等风险。
四、建议与总结
确保合规操作：
- 个体工商户在发放工资时，应确保与员工之间建立真实的劳动关系，并签订书面劳动合同。
- 工资发放应符合当地最低工资标准、支付周期与时效等要求，并依法为员工缴纳社保和代扣代缴个人所得税。
避免违法操作：
- 个体工商户应避免利用个体工商户进行逃避税收、社保缴纳等违法操作。
- 应确保工资发放记录的规范性和准确性，以便在税务核查或劳动纠纷中提供有效证据。
维护员工权益：
- 个体工商户应尊重员工的合法权益，确保员工能够享受应有的待遇和保障。
- 在发生劳动纠纷时，应积极与员工协商解决，避免矛盾升级。
总结：用个体工商户收工资的合法性取决于具体情境和操作方式。为了确保合法性和规范性，个体工商户应遵守相关法律法规要求，确保与员工之间建立真实的劳动关系，并依法进行工资发放和社保缴纳等操作。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。